[发明专利]检测BRCA1基因表达的引物、探针及试剂盒在审
申请号: | 201511022826.9 | 申请日: | 2015-12-30 |
公开(公告)号: | CN105420393A | 公开(公告)日: | 2016-03-23 |
发明(设计)人: | 王秀娟;周艳琳;段卫涛;赵平锋 | 申请(专利权)人: | 武汉海吉力生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京汇泽知识产权代理有限公司 11228 | 代理人: | 程殿军;张瑾 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖技术*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 brca1 基因 表达 引物 探针 试剂盒 | ||
1.检测BRCA1基因表达的引物和探针,其特征在于,
BRCA1基因上游引物:核苷酸序列如SEQIDNO:1所示,
BRCA1基因下游引物:核苷酸序列如SEQIDNO:2所示,
BRCA1基因Taqman荧光探针:核苷酸序列如SEQIDNO:3所示,序列5’端标记荧光报告基团,3’端标记淬灭基团。
2.根据权利要求1所述的检测BRCA1基因表达的引物和探针,其特征在于,BRCA1Taqman荧光探针核苷酸序列5’端的荧光报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为MGB。
3.一种检测BRCA1基因表达的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1或2所述的检测BRCA1基因表达的引物和探针。
4.根据权利要求3所述的检测BRCA1基因表达的试剂盒,其特征在于,还包括用于检测内参基因B2M表达的引物和探针:
B2M基因上游引物:核苷酸序列如SEQIDNO:4所示,
B2M基因下游引物:核苷酸序列如SEQIDNO:5所示,
B2M基因Taqman荧光探针:核苷酸序列如SEQIDNO:6所示。
5.根据权利要求4所述的检测BRCA1基因表达的试剂盒,其特征在于,还包括第一链cDNA合成试剂,荧光定量PCR检测反应液,阳性对照品及阴性对照品;其中阳性对照品为梯度浓度的BRCA1基因标准品和梯度浓度的B2M基因标准品,阴性对照为DEPC水。
6.根据权利要求5所述的检测BRCA1基因表达的试剂盒,其特征在于,所述第一链cDNA合成试剂包括:反转录酶1~5U、反转录10×RTBuffer适量、dNTPs1~2mM、BRCA1基因反转录引物对1~10pM、内参基因B2M反转录引物对1~10pM,DEPC水适量。
7.根据权利要求5所述的检测BRCA1基因表达的试剂盒,其特征在于,所述荧光定量PCR检测反应液包括:Premix、BRCA1基因上下游引物对1~10pM、BRCA1基因Taqman荧光探针1~10pM、B2M基因上下游引物对1~10pM、B2M基因Taqman荧光探针1~10pM、DEPC水适量;所述Premix包括DNA聚合酶1~2U、2.0~5.0mMMgCl2、0.2~0.8mMdNTPs、10×Buffer和RNaseH。
8.权利要求5~7任一所述的检测BRCA1基因表达的试剂盒的使用方法,其特征在于,步骤如下:
(1)以乳腺癌组织和癌旁正常组织为待检样品,提取待检样品中的RNA,反转录成样品cDNA;
(2)荧光定量PCR:以样品cDNA作为模板,用检测BRCA1基因表达的引物和探针、检测内参基因B2M表达的引物和探针进行荧光定量PCR反应;BRCA1基因标准品与B2M基因标准品及阴性对照品也与样品cDNA同时上机进行相同的操作;同一PCR反应绘制两种标准品的标准曲线;
(3)数据采集和分析:将阈值线调整至背景信号及阴性扩增线以上,分析标准曲线的R2在0.99以上,BRCA1基因和B2M基因扩增效率应在94~100%范围,再根据荧光定量PCR仪器给出的Ct值,按照以下公式进行计算:
△Ct(乳腺癌组织)=Ct(乳腺癌组织BRCA1基因)-Ct(乳腺癌组织B2M基因);
△Ct(癌旁正常组织)=Ct(癌旁正常组织BRCA1基因)-Ct(癌旁正常组织B2M基因);
△△Ct=△Ct(乳腺癌组织)-△Ct(癌旁正常组织)
相对表达率=2-△△Ct;相对表达率>1判断为乳腺癌BRCA1基因高表达;相对表达率≤1判断为乳腺癌BRCA1基因低表达。
9.根据权利要求8所述的检测BRCA1基因表达的试剂盒的使用方法,其特征在于,步骤(1)中反转录程序为:50℃,30min;95℃,5min;5℃,5min1个循环。
10.根据权利要求8所述的检测BRCA1基因表达的试剂盒的使用方法,其特征在于,步骤(2)中荧光定量PCR反应程序为:95℃预变性2min;95℃15s,60℃30s40个循环,当荧光基团选择FAM时在60℃30s时采集荧光信号。
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