[发明专利]检测OSTC基因mRNA的可变腺苷酸位点使用情况的引物及方法有效
申请号: | 201511033760.3 | 申请日: | 2015-12-31 |
公开(公告)号: | CN105441564B | 公开(公告)日: | 2020-05-29 |
发明(设计)人: | 曹永长;薛春宜;李杰;何亮亮 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京市盈科律师事务所 11344 | 代理人: | 马丽丽 |
地址: | 510000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 ostc 基因 mrna 可变 腺苷酸 使用 情况 引物 方法 | ||
1.一种检测OSTC基因mRNA的可变腺苷酸位点使用情况的引物,其特征在于,所述引物包括第一对引物和第二对引物,其序列与OSTC基因3’非翻译区中的两对序列或其互补序列相同;
所述第一对引物的序列与OSTC基因3’非翻译区中common区域的部分序列或其互补序列相同,所述第二对引物的序列与OSTC基因3’非翻译区中Extended区域的部分序列或其互补序列相同;
所述第一对引物用于扩增common区域的Proximal片段,所述第二对引物用于扩增Extended区域的Distal片段;
所述第一对引物的序列如SEQ ID NO:1-2所示或其互补序列,所述第二对引物的序列如SEQ ID NO:3-4所示或其互补序列。
2.一种检测OSTC基因mRNA的可变腺苷酸位点使用情况的非诊断方法,其特征在于,包括以下步骤:
提取样品总RNA,逆转录得到cDNA;
以cDNA为模板,使用第一对引物qPCR扩增common区域的Proximal片段,得到CT值pro;
以cDNA为模板,使用第二对引物扩增Extended区域的Distal片段,得到CT值dis;
计算CT值dis与CT值pro的比值;
所述第一对引物的序列如SEQ ID NO:1-2所示或其互补序列,所述第二对引物的序列如SEQ ID NO:3-4所示或其互补序列。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述qPCR的反应体系为:
cDNA模板 1μL,
2×qPCR Master Mix 5μL,
上游引物 0.25μL,
下游引物 0.25μL,
无核酸酶水 至10μL。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述qPCR的反应条件为:
预变性:95℃ 1min;扩增:95℃ 5s,62℃ 15s, 72℃ 10s 信号收集,40个循环;溶解曲线:95℃ 1min;冷却:37℃ 1min。
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