[发明专利]分析和解释抗微生物敏感性测试的自动化方法有效
申请号: | 201580054127.4 | 申请日: | 2015-10-05 |
公开(公告)号: | CN107002115B | 公开(公告)日: | 2021-11-30 |
发明(设计)人: | J-M·罗朗;D·拉乌特;S·莱帕赫;S·巴菲特 | 申请(专利权)人: | 地中海传染基金会;埃克斯-马赛大学;公共援助马赛医院;国家科学研究中心;国家健康科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/04 | 分类号: | C12Q1/04;C12Q1/18;G06T7/00 |
代理公司: | 北京戈程知识产权代理有限公司 11314 | 代理人: | 程伟;韩文华 |
地址: | 法国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分析 解释 微生物 敏感性 测试 自动化 方法 | ||
1.一种自动分析和解释分析的细菌样本的抗菌谱的方法,所述方法用于确定对至少一种抗微生物化合物的抗性或敏感性的表型,所述表型选自多种不同种类的参照细菌中的每种参照细菌种类的多种不同的参照表型,其中:
a)使用确定的方法,在固体培养介质上,制备分析的细菌样本的抗菌谱,所述方法包括:
·在所述固体培养介质上,沉积确定浓度的细菌样本,所述细菌样本的浓度单位为CFU/mL;
·在所述固体培养介质上,沉积确定数量n的多个基底,其中n在5至20的范围,所述基底以确定的排列和确定的形式,每个含有确定浓度的确定的抗微生物化合物,并且对于n个所述基底中的每一个适合于扩散一种确定的抗微生物化合物;和
·在确定的条件下以及确定的持续时间,孵育沉积在所述固体培养介质上的细菌样本;和
b)获取在步骤a)中获得的抗菌谱的照片图像;和
c)通过使用图像识别软件将步骤b)中获得的照片图像与由参照图像组成的数据库中的参照抗菌谱的参照图像进行比较,确定分析的细菌样本的所述表型,对于每种参照细菌种类的每种参照表型,所述数据库包含多种相同细菌的p种不同菌株的抗菌谱的至少p种不同的参照图像,其中p在6至42的范围,其中所述图像识别软件用于比较对应于基底周围的抑制区域的圆环轮廓的形状。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在步骤c)中,所有参照抗菌谱使用与分析的细菌样本的抗菌谱相同方法制备,并且所述参照图像和分析的图像是用相同的照片图像捕获装置和在相同条件下拍摄的,所述相同条件是相同的距离、相同的亮度、相同的背景,以及相同分辨率。
3.根据权利要求1至2中任一项所述的方法,其特征在于,在步骤c)中,其中所述基底是抗生素薄片,且在抗生素薄片上指定抗生素代码字母和剂量数字。
4.根据权利要求1至2中任一项所述的方法,其特征在于,确定分析的图像和参照图像之间的最小可接受的相似性百分比,下文称为相似性阈值,如果识别软件评估分析样本的细菌抗菌谱的图像与对应于所述参照细菌菌种的所述参照表型的参照图像之间的相似性百分比不小于70%,则确定分析样本的细菌表现所述参照细菌的所述参照表型。
5.根据权利要求1至2中任一项所述的方法,其特征在于,确定每种参照细菌菌种的每种参照表型的p种不同菌株的不同抗菌谱的所述不同的 参照图像之间的最小阈值相似性百分比,下文称为参照相似性阈值,确定参照相似性阈值百分比,其对应于每种参照细菌菌种的每种参照表型的两种最不同的参照图像之间的最低相似性百分比,如果识别软件评估分析样本的细菌抗菌谱的图像与对应于所述参照细菌菌种的所述参照表型的参照图像之间的相似性百分比不小于参照相似性阈值,则分析样本的细菌被确定为表现所述参照细菌的所述参照表型。
6.根据权利要求1至2中任一项所述的方法,其特征在于,所述参照表型是给定的抗生素或抗生素组合抗性或敏感性分类。
7.根据权利要求1至2中任一项所述的方法,其特征在于,参照表型是多种抗生素和/或抗生素组合的抗性或敏感性分类。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述参照表型包括两种抗生素间的协同作用表型,所述两种抗生素对应于这样两种抗生素,即当两种抗生素单独使用时对于参照细菌是抗性的,并且当两种抗生素组合使用时对于参照细菌是敏感的。
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