[发明专利]分析和解释抗微生物敏感性测试的自动化方法

说明书

本发明涉及一种用于解释抗微生物敏感性测试的不同图像的方法。根据所述方法，可以通过使用参照抗微生物敏感性测试的照片图像库比较照片，来识别抗生素抗性表型，而不需要根据EUCAST或CA‑SFM解释数据解释所述图像；条件是对于给定的表型，可获得相同菌种的几种细菌的照片集合以及可获得相同表型。

技术领域

本发明涉及在化学微生物学领域中用于自动化读取和解释微生物对抗微生物剂的敏感性的测试的方法。

背景技术

本发明可主要在细菌学中用于细菌对抗生素的敏感性的测试，该测试被称为“抗菌谱(antibiogrammes)”，以及在感染性疾病的研究中的其它领域，比如真菌对抗真菌剂的敏感性的显微测试，该测试可以称为抗真菌谱。

在本说明书中，术语“抗菌谱”用作测试细菌针对抗生素化合物和测试真菌针对抗真菌化合物的总称。

抗菌谱是一种实验室技术，试图通过评估细菌生长被抑制的程度来测试细菌菌株对一种或多种潜在或已知抗生素的敏感性。原理在于在一种或多种抗生素的存在下，放置细菌培养物并观察培养物的发育和存活的结果。为此，例如可以将多个抗生素浸渍的薄片放置在沉积在固体培养介质上的细菌菌株上。然后，抗生素从薄片扩散，由此在薄片周围产生浓度梯度，其生长抑制区域对于裸眼是可见的，如果细菌对抗生素敏感，则薄片周围出现暗圆环的形式。根据构成抗生素薄片的盘周围的抑制区域的圆的直径，存在三种类型的解释：菌株或细菌可以是敏感的、中等的或抗性的。

这种薄片及其不同剂量的抗生素根据欧洲抗微生物敏感性测试委员会(EuropeanCommittee on Antimicrobial Susceptibility Testing，EUCAST)：www.eucast.org[T.Winstanley,P.Courvalin(2011),Expert systems in clinical microbiologyClin.Microbiol.Rev.24:pp.515-556.24/3/515[pli]；10.1128/CMR.00061-101,andR.Leclercq,R.Canton,D.F.Brown,C.G.Giske,P.Heisig,A.P.MacGowan,J.W.Mouton,P.Nordmann,A.C.Rodloff,G.M.Rossolini,C.J.Soussy,M.Steinbakk,T.G.Winstanley,and G.Kahlmeter(2013),EUCAST Expert rules in antimicrobial susceptibilitytestingClin.Microbiologie Infect.19:141-160.10.1111/j.1469-0691.2011.03703.x]和/或法国微生物学会的法国抗菌素委员会(French Comitéde l'Antibiogramme de la Société de Microbiologie，CA-SFM):www.sfm-microbiologie.org专家系统的建议进行标准化。抗生素薄片由基底材料制成，所述基底材料含有已知浓度的抗生素，并且适合扩散抗生素，比如浸渍有已知浓度的抗生素的吸水纸，依据抗生素，所述浸渍的抗生素大约范围在1微克(μg)至500微克，并且它们由供应商i2a(Montpellier,法国)、BD(Becton Dickinson,美国)、Bio-Rad(Hercules,美国)、Biomerieux(Marcy l'Etoile,法国)销售。

在固相琼脂上用于进行抗菌谱的各种抗生素薄片带有缩写形式的抗生素的名称，以在薄片的顶面标记一到三个字母代码的形式标准化。

结果的读取基本上由测量圆环(微生物菌株的生长被抑制的区域)的直径组成。抑制直径越大，细菌对被测试抗生素的敏感性越高，反之亦然。确定薄片的剂量以便获得圆环直径，所述圆环直径与所讨论的抗生素对被测试细菌的最小抑制浓度(CMI)成比例。

抑制直径以毫米(mm)计，用尺子手工测量或通过使用能够自动读取直径的读数器测量。自动读数器包含扫描仪，其具有照相机和抗生素薄片和位于这些盘周围的抑制区域的探测器。