[发明专利]合成核酸的方法和设备在审
申请号: | 201580054493.X | 申请日: | 2015-08-18 |
公开(公告)号: | CN107109452A | 公开(公告)日: | 2017-08-29 |
发明(设计)人: | J·W·爱夫卡维茨 | 申请(专利权)人: | 分子组装公司 |
主分类号: | C12P19/34 | 分类号: | C12P19/34;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京易光知识产权代理有限公司11596 | 代理人: | 耿晓兵 |
地址: | 美国加利福尼亚州*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 合成 核酸 方法 设备 | ||
1.一种合成寡核苷酸的方法,其包含:
在存在核苷酸转移酶和不存在核酸模板下使连接到固体支撑物的寡核苷酸暴露于核苷酸类似物,以使得所述核苷酸类似物并入所述寡核苷酸中,
其中所述核苷酸类似物包含通过可裂解连接子与抑制因子偶联的核苷酸,所述抑制剂在空间上防止所述核苷酸基转移酶催化核苷酸或其它核苷酸类似物向所述寡核苷酸中并入直到通过裂解该等可裂解连接子而将所述抑制剂去除。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述核苷酸类似物包含以下结构:
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述核苷酸类似物包含以下结构:
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述抑制因子包含以下结构:
其中n=1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
5.根据权利要求1所述的方法,其中所述抑制因子包含类多肽。
6.根据权利要求1所述的方法,其中所述抑制因子包含聚合物。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述聚合物包含聚乙二醇。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述抑制因子是蛋白。
9.根据权利要求1所述的方法,其中所述抑制因子是纳米粒子。
10.根据权利要求1所述的方法,其中所述抑制因子是直径大于的大分子。
11.根据权利要求1所述的方法,其中连接到所述固体支撑物的所述核酸在存在水溶液下暴露于pH值在约6.5与8.5之间的所述核苷酸类似物。
12.根据权利要求1所述的方法,连接到所述固体支撑物的所述核酸在约35℃与39℃之间的温度下在存在水溶液下暴露于所述核苷酸类似物。
13.根据权利要求1所述的方法,其中所述固体支撑物是珠粒、孔或栓钉。
14.根据权利要求1所述的方法,其中所述核酸是单链的。
15.根据权利要求1所述的方法,其中所述可裂解连接子包含当自所述核苷酸类似物裂解时形成环状副产物的部分。
16.根据权利要求1所述的方法,其进一步包含:
使所述可裂解连接子裂解以产生天然核苷酸;和
在存在核苷酸基转移酶和不存在核酸模板下使所述天然核苷酸暴露于第二核苷酸类似物。
17.根据权利要求1所述的方法,其进一步包含使所述寡核苷酸暴露于核酸外切酶。
18.根据权利要求1所述的方法,其进一步包含提供包含所述核苷酸类似物和所述核苷酸基转移酶的水溶液。
19.根据权利要求1所述的方法,其中所述抑制因子包含带电部分。
20.根据权利要求1所述的方法,其中所述核苷酸类似物包含核糖或脱氧核糖。
21.根据权利要求1所述的方法,其中所述核苷酸底物包含选自由以下组成的群组的碱基:腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶以及尿嘧啶。
22.根据权利要求1所述的方法,其中所述核苷酸基转移酶包含与SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3或SEQ ID NO.5至少约90%一致的蛋白质序列。
23.根据权利要求1所述的方法,其中所述核苷酸基转移酶来源于具有与SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4或SEQ ID NO.6至少约90%一致的核苷酸序列的生物体。
24.根据权利要求1所述的方法,其中所述核苷酸类似物以小液滴形式递送。
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