[发明专利]导出纳米孔阵列的测量结果的方法以及测序芯片

说明书

公开了一种导出基于纳米孔的测序芯片上的纳米孔传感器的测量结果的方法。测量与纳米孔传感器相关联的电特性。处理与纳米孔传感器相关联的电特性。确定用于所述电特性和一个或多个先前的电特性的概要。导出用于所述电特性和一个或多个先前的电特性的概要。确定概要包括确定所述电特性和一个或多个先前的电特性的至少一部分对应于纳米孔传感器处的碱基调用事件。概要表示所述电特性和所述一个或多个先前电特性的所述至少一部分。

背景技术

半导体行业内的超小型化的进步近年来已使得生物技术能够开始将传统上庞大的传感工具封装到越来越小的外形因数中、封装到所谓的生物芯片上。将期望的是开发的使得其更加稳健、高效且成本有效的用于生物芯片技术。

附图说明

在以下详细描述和附图中公开了本发明的各种实施例。

图1图示出基于纳米孔的测序芯片中的细胞100的实施例。

图2图示出用纳米SBS技术来执行核苷酸测序的细胞200的实施例。

图3图示出用预加载标记来执行核苷酸测序的细胞的实施例。

图4图示出用于用预加载标记的核酸测序的过程400的实施例。

图5图示出在基于纳米孔的测序芯片的细胞中测量的离子电流阻断信号500的实施例。

图6图示出用于导出基于纳米孔的测序芯片上的纳米孔传感器的测量结果的过程600的实施例的流程图。

图7图示出基于纳米孔的测序芯片的细胞中的离子电流阻断信号的测量结果的示例性集合。

图8图示出用于确定基于纳米孔的测序芯片的细胞中的离子电流阻断信号的测量结果的概要的过程800的实施例的流程图。

具体实施方式

可以用许多方式来实现本发明，包括为过程；设备；系统；合成物；体现在计算机可读存储介质上的计算机程序产品；和/或处理器，诸如被配置成执行存储在被耦合到处理器的存储器上的和/或由被耦合到处理器的存储器提供的指令的处理器。在本说明书中，这些实施方式或本发明可以采取的任何其它形式可以称为技术。一般地，在本发明的范围内可以改变所公开过程的步骤的顺序。除非另外说明，可以将被描述为被配置成执行任务的诸如处理器或存储器之类的组件实现为被临时地配置成在给定时间执行任务的一般组件或被制造成执行该任务的特定组件。如本文所使用的，术语‘处理器’指代被配置成处理数据（诸如计算机程序指令）的一个或多个装置、电路和/或处理核。

下面连同图示出本发明的原理的附图一起提供本发明的一个或多个实施例的详细描述。结合此类实施例描述了本发明，但本发明不限于任何实施例。本发明的范围仅仅受到权利要求的限制，并且本发明涵盖许多替换、修改和等同物。在以下描述中阐述了许多特定细节以便提供本发明的透彻理解。这些细节是为了示例的目的而提供的，并且根据权利要求可以在没有这些特定细节中的某些或全部的情况下实践本发明。出于清楚的目的，尚未详细地描述在与本发明相关的技术领域内已知的技术材料，使得不会使本发明不必要地含糊难懂。

在内径方面具有大约一纳米的孔尺寸的纳米孔膜装置在快速核苷酸排序中已显示出前途。当跨浸没在传导流体中的纳米孔施加电势时，可以观察归因于离子跨纳米孔的传导的小离子电流。电流的大小对孔大小敏感。

可以将基于纳米孔的测序芯片用于DNA测序。基于纳米孔的测序芯片结合了被配置为阵列的大量传感器细胞。例如，一百万个细胞的阵列可以包括1000行乘以1000列的细胞。