[发明专利]使用二代测序预测器官移植排斥的方法

权利要求书

1.一种通过二代测序(NGS)或数字碱基扩增来预测生物样品中器官移植排斥的方法，所述生物样品获自从供体接受器官的受体，所述方法包括如下步骤：

从自供体接受器官的受体非侵入性获得生物样品，所述生物样品含有源于供体和源于受体的无细胞核酸分子；

扩增自所述生物样品分离的无细胞核酸分子中的三种或更多种标志物序列，所述标志物序列选自表1至10所示的标志物序列；

通过二代测序(NGS)或数字碱基扩增分析所扩增的序列；

基于所述序列的分析，测定各所述源于供体的标志物序列和各所述源于受体的标志物序列之间的比率；以及

将所述比率与一个或多个截断值进行比较。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述生物样品是血液、血浆、血清、尿液或唾液。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述扩增所述标志物序列的步骤进一步包括扩增表1至10中所列的所有标志物。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述标志物序列之间的比率是各所述源于供体的标志物序列的量和各所述源于受体的标志物序列的量之间的比率，所述标志物选自表1至10中所示的标志物。

5.根据权利要求1所述的方法，其中将所述标志物序列之间的比率连同序列误差率一起计算。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所扩增的所述生物样品中的标志物序列的长度小于200bp。

7.根据权利要求1所述的方法，其中所述截断值是从正常生物样品确立的参考值。

8.一种通过二代测序(NGS)或数字碱基扩增来预测获自从供体接受器官的受体的生物样品中器官移植排斥的方法，所述方法包括如下步骤：

从自供体接受器官的受体非侵入性获得生物样品，所述生物样品含有源于供体和源于受体的无细胞核酸分子；

扩增自所述生物样品分离的无细胞核酸分子中的三种或更多种标志物序列，所述标志物序列选自表1至10所示的标志物序列；

通过二代测序(NGS)或数字碱基扩增分析所扩增的序列；

基于所述序列的分析，测定各所述源于供体的标志物序列和各所述源于受体的标志物序列之间的比率；以及

随着时间测定所述比率，当各所述源于供体的标志物序列的比率增加时预测所述受体是否具有移植排斥、移植物功能障碍或器官衰竭。

9.根据权利要求8所述的方法，其中所述生物样品是血液、血浆、血清、尿液或唾液。

10.根据权利要求8所述的方法，其中所述扩增所述标志物序列的步骤进一步包括扩增表1至10中所列的所有标志物。

11.根据权利要求8所述的方法，其中所述标志物序列之间的比率是各所述源于供体的标志物序列的量和各所述源于受体的标志物序列的量之间的比率，所述标志物选自表1至10中所示的标志物。

12.根据权利要求8所述的方法，其中将所述标志物序列之间的比率连同序列误差率一起计算。

13.根据权利要求8所述的方法，其中所扩增的所述生物样品中的标志物序列的长度小于200bp。

14.根据权利要求8所述的方法，其中所述比率测定时间选自器官移植前、紧接着器官移植后、以及器官移植后1天、2天、1周、1个月、2个月、3个月、1年、2年以及10年组成的组。

15.一种计算机系统，其包括以多个控制计算系统的指令编码的计算机可读介质，以通过使用二代测序(NGS)或数字碱基扩增对于获自从供体接受器官的受体的生物样品中的器官移植排斥进行预测操作，

其中所述生物样品含有自供体接受器官的受体的源于供体的和源于受体的无细胞核酸分子，

其中所述操作包括如下步骤：

接收通过使用二代测序(NGS)或数字碱基扩增分析自所述生物样品分离的无细胞核酸分子中的三种或更多种标志物序列而获得的数据，所述标志物选自表1至10所示的标志物；

基于所述序列的分析，测定各所述源于供体的标志物序列和各所述源于受体的标志物序列之间的比率；

将所述比率与一个或多个截断值进行比较；以及

基于所述比较，预测所述受体中是否将存在器官移植排斥。