[发明专利]一种用于检测山羊副流感病毒3型核苷酸片段的引物和探针序列在审
申请号: | 201610003794.6 | 申请日: | 2016-01-04 |
公开(公告)号: | CN105441593A | 公开(公告)日: | 2016-03-30 |
发明(设计)人: | 李基棕;江杰元;李文良;毛立;郝飞;杨蕾蕾;张纹纹 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 张素卿 |
地址: | 210014 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 山羊 流感病毒 核苷酸 片段 引物 探针 序列 | ||
1.一种用于检测山羊副流感病毒3型核苷酸片段的引物对和探针序列,其特征在于,所述的引物对为:由序列为GCTTGGCTTCTTTGAAATGG的上游引物CPIVTF和序列为GCCTGCAGAAGTTCCTTGTC的下游引物CPIVTR组成的引物对;探针CPIVTM序列为CAATCGGACTAGCCAAGTATGGTGGGA。
2.根据权利要求1所述引物对和探针序列,其特征在于,所述引物对和探针序列用于检测山羊副流感病毒3型核苷酸片段的方法,包括:
1)待测模板的制备:取100μl血清或取100mg组织样品,加入500μlPBS缓冲液进行充分研磨,-20℃反复冻融3次,12000rpm离心10分钟,取上清液100μl;
加入400μlTRIzol试剂,剧烈振荡30秒,室温孵育5-10分钟,12000rpm离心5分钟,弃沉淀,加入100μl氯仿,剧烈振荡30秒,室温孵育5-10分钟,4℃,12000rpm离心15分钟,吸取上层水相至另一新离心管中,加入等体积的异丙醇,颠倒混匀10次,室温孵育30分钟,4℃,12000rpm离心15分钟,弃上清,RNA沉淀于管底,加入500μl75%乙醇(DEPC处理的水配置),温和振荡离心管,悬浮沉淀,4℃,12000rpm离心5分钟,尽量弃上清,室温晾干或真空干燥5-10分钟,用20μl无RNase水溶解,即为检测用RNA模板;
2)使用TaKaRa公司OneStepPrimeScriptTMRT-PCRKit配制反应体系:
试剂用量/终浓度
2×OneStepRT-PCRBufferⅢ10μl/1×
TaKaRaExTaqHS(5U/μl)0.4μl
PrimeScriptRTEnzymeMixⅡ0.4μl
PCRForwardPrimer(10μM)0.4μl/0.2μM
PCRReversePrimer(10μM)0.4μl/0.2μM
TaqManProbe(10μM)0.8μl/0.4μM
ROXReferenceDyeⅠ(50×)0.4μl/1×
TotalRNA2μl
RNaseFreedH2O5.2μl
将加好样品的PCR管置于荧光定量PCR仪中进行扩增,反应程序如下:42℃,5分钟,反转录;95℃,10秒,预变性;95℃,5秒,60℃34秒,40个循环;
山羊副流感病毒3型实时荧光定量PCR的检测结果判定:经检测,若待检样品中含有山羊副流感病毒3型核苷酸则显示阳性扩增曲线,其检测灵敏度可达10个拷贝/ml;若待检样品中不含有山羊副流感病毒3型核苷酸则无扩增信号。
3.根据权利要求2所述引物对和探针序列,其特征在于,所述引物对和探针序列用于检测山羊副流感病毒3型核苷酸片段的方法中其检测灵敏度达10个拷贝/ml。
4.含有权利要求1所述引物对和探针序列的试剂盒。
5.权利要求1所述引物对和探针序列在制备用于检测山羊副流感病毒3型的试剂盒产品中的应用。
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