[发明专利]一种用于检测山羊副流感病毒3型核苷酸片段的引物和探针序列在审

专利信息
申请号: 201610003794.6 申请日: 2016-01-04
公开(公告)号: CN105441593A 公开(公告)日: 2016-03-30
发明(设计)人: 李基棕;江杰元;李文良;毛立;郝飞;杨蕾蕾;张纹纹 申请(专利权)人: 江苏省农业科学院
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 张素卿
地址: 210014 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 检测 山羊 流感病毒 核苷酸 片段 引物 探针 序列
【权利要求书】:

1.一种用于检测山羊副流感病毒3型核苷酸片段的引物对和探针序列,其特征在于,所述的引物对为:由序列为GCTTGGCTTCTTTGAAATGG的上游引物CPIVTF和序列为GCCTGCAGAAGTTCCTTGTC的下游引物CPIVTR组成的引物对;探针CPIVTM序列为CAATCGGACTAGCCAAGTATGGTGGGA。

2.根据权利要求1所述引物对和探针序列,其特征在于,所述引物对和探针序列用于检测山羊副流感病毒3型核苷酸片段的方法,包括:

1)待测模板的制备:取100μl血清或取100mg组织样品,加入500μlPBS缓冲液进行充分研磨,-20℃反复冻融3次,12000rpm离心10分钟,取上清液100μl;

加入400μlTRIzol试剂,剧烈振荡30秒,室温孵育5-10分钟,12000rpm离心5分钟,弃沉淀,加入100μl氯仿,剧烈振荡30秒,室温孵育5-10分钟,4℃,12000rpm离心15分钟,吸取上层水相至另一新离心管中,加入等体积的异丙醇,颠倒混匀10次,室温孵育30分钟,4℃,12000rpm离心15分钟,弃上清,RNA沉淀于管底,加入500μl75%乙醇(DEPC处理的水配置),温和振荡离心管,悬浮沉淀,4℃,12000rpm离心5分钟,尽量弃上清,室温晾干或真空干燥5-10分钟,用20μl无RNase水溶解,即为检测用RNA模板;

2)使用TaKaRa公司OneStepPrimeScriptTMRT-PCRKit配制反应体系:

试剂用量/终浓度

2×OneStepRT-PCRBufferⅢ10μl/1×

TaKaRaExTaqHS(5U/μl)0.4μl

PrimeScriptRTEnzymeMixⅡ0.4μl

PCRForwardPrimer(10μM)0.4μl/0.2μM

PCRReversePrimer(10μM)0.4μl/0.2μM

TaqManProbe(10μM)0.8μl/0.4μM

ROXReferenceDyeⅠ(50×)0.4μl/1×

TotalRNA2μl

RNaseFreedH2O5.2μl

将加好样品的PCR管置于荧光定量PCR仪中进行扩增,反应程序如下:42℃,5分钟,反转录;95℃,10秒,预变性;95℃,5秒,60℃34秒,40个循环;

山羊副流感病毒3型实时荧光定量PCR的检测结果判定:经检测,若待检样品中含有山羊副流感病毒3型核苷酸则显示阳性扩增曲线,其检测灵敏度可达10个拷贝/ml;若待检样品中不含有山羊副流感病毒3型核苷酸则无扩增信号。

3.根据权利要求2所述引物对和探针序列,其特征在于,所述引物对和探针序列用于检测山羊副流感病毒3型核苷酸片段的方法中其检测灵敏度达10个拷贝/ml。

4.含有权利要求1所述引物对和探针序列的试剂盒。

5.权利要求1所述引物对和探针序列在制备用于检测山羊副流感病毒3型的试剂盒产品中的应用。

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