[发明专利]用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物、探针及试剂盒在审
申请号: | 201610013548.9 | 申请日: | 2016-01-11 |
公开(公告)号: | CN105441573A | 公开(公告)日: | 2016-03-30 |
发明(设计)人: | 朱峰;邹芳;段卫涛;赵平锋 | 申请(专利权)人: | 武汉海吉力生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京汇泽知识产权代理有限公司 11228 | 代理人: | 程殿军;张瑾 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖技术*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 人类 jak2 基因 v617f 突变 引物 探针 试剂盒 | ||
1.用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,其特征在于,核苷酸序列如下:
突变上游引物JW1-F:SEQIDNO:1,
突变下游ARMS引物JM1-R:SEQIDNO:2,
检测探针JW1-P:SEQIDNO:3,
阻断探针JW1-B:SEQIDNO:4;
其中,检测探针核苷酸序列5’端标记有荧光基团,3’端标记有淬灭基团;阻断探针的核苷酸序列5’端经过双脱氧修饰,3’端标记有淬灭基团。
2.根据权利要求1所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,其特征在于,所述荧光基团为FAM,所述淬灭基团为MGB。
3.用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1或2所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针。
4.根据权利要求3所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,还包括外控引物和探针,核苷酸序列如下:
外控上游引物JW1-F:SEQIDNO:1,
外控下游引物JW1-R:SEQIDNO:5,
外控检测探针JW1-P:SEQIDNO:3,外控检测探针核苷酸序列的5’端标记有FAM,3’端标记有MGB。
5.根据权利要求4所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,还包括内控引物和探针,核苷酸序列如下:
内控上游引物IC-F:SEQIDNO:6,
内控下游引物IC-R:SEQIDNO:7,
内控检测探针IC-P:SEQIDNO:8,内控检测探针核苷酸序列的5’端标记有JOE,3’端标记有BHQ1。
6.根据权利要求5所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,还包括阳性对照品和内控品,阳性对照品包括含有发生1849G>T碱基变化的CKIT基因片段>gi|568815589:5073601-5074000的阳性质粒,含有JAK2基因保守序列>gi|568815589:5054501-5054900段碱基的外控质粒,含有matK基因保守序列>gi|11994090:c2400-2001段碱基的内控质粒;内控品为含有matK基因保守序列>gi|11994090:c2400-2001段碱基的内控质粒。
7.根据权利要求5所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,试剂盒中的反应体系分为两种:
检测反应体系:包括用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,内控引物和探针,ABpremix,10×buffer和ddH2O;
质控反应体系:包括外控引物和探针,内控引物和探针,ABpremix,10×buffer和ddH2O;
所述ABpremix为美国应用生物系统公司产品FastAdvancedMasterMix;所述10×buffer为10倍浓度的缓冲液,缓冲液中含有Mg2+。
8.权利要求7所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒的使用方法,其特征在于,提取待检样品的基因组DNA,分别加入到检测反应体系和质控反应体系,进行荧光定量PCR反应;另外设置非模板对照和阳性对照,与待检样品的基因组DNA进行同样的操作;根据Ct值分析检测结果:
首先需要满足JOE信号Ct值≤25,非模板对照的FAM信号不起线,阳性对照的FAM信号Ct值≤20;9<Ct质控≤18;然后按照△Ct=Ct检测-Ct质控判定,△Ct≤8为阳性,△Ct>8为阴性;
所述Ct检测为待检样品的基因组DNA在检测反应体系中进行荧光定量PCR获得的Ct值,所述Ct质控为待检样品的基因组DNA在质控反应体系中进行荧光定量PCR获得的Ct值。
9.根据权利要求8所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒的使用方法,其特征在于,荧光定量PCR反应的条件为:
95℃10min;
92℃15sec,58℃1min,共15个循环;
92℃15sec,60℃1min,共30个循环;在60℃时收集信号。
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