[发明专利]一种用于长牡蛎亲子鉴定的微卫星多重PCR方法有效

专利信息
申请号: 201610018599.0 申请日: 2016-01-12
公开(公告)号: CN105441576B 公开(公告)日: 2019-08-16
发明(设计)人: 李琪;刘婷;于红 申请(专利权)人: 中国海洋大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/686
代理公司: 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 代理人: 孙洪叶
地址: 266100 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 牡蛎 亲子鉴定 卫星 多重 pcr 方法
【权利要求书】:

1.一种用于长牡蛎亲子鉴定的微卫星多重PCR方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)提取长牡蛎亲本和子代个体的DNA;

(2)长牡蛎多态性微卫星引物的筛选:根据引物筛选软件以及现有文献记载的长牡蛎引物序列,合成引物,并通过对长牡蛎个体进行PCR扩增,筛选出扩增稳定、特异性强的引物,所述引物包括正向引物、反向引物以及通用引物,所述通用引物上带有荧光标记;所述引物序列如下:

该引物序列包括18种正、反向引物以及1种带有荧光标记的通用引物序列;

(3)对步骤(1)得到的长牡蛎亲本和子代个体的DNA进行多重PCR扩增:对步骤(2)中筛选得到的引物进行组合,并通过优化PCR反应条件得到6组多重PCR组合;

所述的6组多重PCR组合如下:

(4)获得长牡蛎亲本和子代的基因型数据:对步骤(3)得到的多重PCR扩增产物进行荧光信号检测,从而获得亲本和子代的基因型数据;

(5)通过基因序列分析软件对上述得到的基因型数据进行分析对比,以对长牡蛎亲本和子代进行亲缘关系鉴定。

2.如权利要求1所述的微卫星多重PCR方法,其特征在于,所述正向引物的5’端添加M13(-21)通用引物序列,荧光标记添加在M13(-21)通用引物序列的5’端。

3.如权利要求1所述的微卫星多重PCR方法,其特征在于,上述步骤(3)中的多重PCR扩增的反应程序分为两步:前35个循环使用50℃~60℃的退火温度,后8个循环使用53℃的退火温度。

4.如权利要求1所述的微卫星多重PCR方法,其特征在于,上述步骤(3)中的引物组合和优化PCR条件具体操作为:首先将所述各引物两两组合,选出扩增清晰的组合再进行3个位点的多重PCR体系的构建;通过优化退火温度、引物浓度、反应体系最终得出6组多重PCR组合。

5.如权利要求1所述的微卫星多重PCR方法,其特征在于,上述步骤(4)中荧光信号检测采用毛细管荧光电泳方法。

6.如权利要求1所述的微卫星多重PCR方法,其特征在于,所述的基因序列分析软件为Genemapper v4.0和Cervus 3.0。

7.如权利要求1所述的微卫星多重PCR方法,其特征在于,所述的长牡蛎子代DNA提取选取的实验材料是D形幼虫。

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