[发明专利]检测水稻抗稻瘟病基因Pigm的引物、试剂盒及基因分型方法在审
| 申请号： | 201610020747.2 | 申请日： | 2016-01-13 |
| 公开（公告）号： | CN105506127A | 公开（公告）日： | 2016-04-20 |
| 发明（设计）人： | 曾晓珊;杨远柱;白珍安;秦鹏;彭丹;胡小淳 | 申请（专利权）人： | 袁隆平农业高科技股份有限公司;湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君 |
| 地址： | 410001 湖南省*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 检测 水稻 稻瘟病 基因 pigm 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于检测水稻抗稻瘟病基因Pigm的Taqman定性基因型分 析PCR引物，其特征在于，所述引物包括：
上游引物S1806GC-F：5’-ACTCCTTTCATCCCATAAAATACAA ACGT-3’；
下游引物S1806GC-R：5’-CGCCTCTCCAGATTTGCAGTAT-3’。
2.配合权利要求1所述引物使用的探针，其特征在于，所述探针 包括：
S1806-VIC：5’-CCCAAATGTTAGAGATCATA-3’；
S1806-FAM：5’-CCCAAATGTTAGACATCATA-3’；
其中，VIC、FAM均为荧光报告基团。
3.一种用于水稻抗稻瘟病Pigm基因分型检测的试剂盒，其特征 在于，包括权利要求1所述的引物和权利要求2所述的探针。
4.一种水稻抗稻瘟病基因Pigm的Taqman定性基因型分析方法， 其特征在于，所述方法包括如下步骤：
1)提取待测水稻的基因组DNA，调整浓度至20-25ng/μl左右；
2)利用权利要求1所述的引物和权利要求2所述的探针，对水稻 基因组DNA进行基因分型检测，当基因分型结果为GG或GC，表明水 稻基因组存在抗稻瘟病基因Pigm。
5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，PCR反应体系以20 μl计为：2×TaqManGenotypingMasterMix10μl，20×TaqManSNPGenotypingAssays1μl，20-25ng/μlDNA4μl，ddH2O补足至20μl。
6.根据权利要求4或5所述的方法，其特征在于，PCR反应程序 为：95℃预变性10分钟；95℃变性15秒，56℃退火30秒，72℃延伸1 分钟，共40个循环；60℃保持1分钟。
7.权利要求3所述的试剂盒在水稻抗稻瘟病Pigm基因分型检测中 的应用。
8.权利要求1所述的引物和权利要求2所述的探针在抗稻瘟病水 稻选育方面的应用。
9.权利要求3所述的试剂盒在抗稻瘟病水稻选育方面的应用。
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