[发明专利]一种基因组DNA序列精准编辑方法在审
申请号: | 201610031817.4 | 申请日: | 2016-01-18 |
公开(公告)号: | CN105567734A | 公开(公告)日: | 2016-05-11 |
发明(设计)人: | 李东升;丁妍;卢智勇 | 申请(专利权)人: | 丹弥优生物技术(湖北)有限公司 |
主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 张涛 |
地址: | 430075 湖北省武汉市东湖开发区高新大道*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基因组 dna 序列 精准 编辑 方法 | ||
1.一种基因组DNA序列精准编辑方法,按如下步骤进行:
1)构建一个两侧由同源序列组成的任意突变基因;
2)以目标位点一侧为靶点设计相应的TALEN或CRISPR/Cas9;
3)将该预先构造好的donorDNA与TELEN或CRISPR/Cas9同时转染到操作细胞内; 导致该基因靶点处双链断开,并且随后部分断端会以donorDNA为模板进行修复;
4)通过单细胞克隆培养与基因测序,筛选出单等位基因修饰的细胞株;
当两个等位基因均发生了预期突变,基因组DNA序列精准编辑即告成功;
所述donorDNA含突变内容和相关基因的同源序列;所述TALEN或CRISPR/Cas9 是能够特异性地分别与靶点的两侧或单侧结合从而导致靶点处DAN双链断开的质粒; TALEN是一对质粒,CRISPR/Cas9是单质粒。
2.权利要求1所述的方法,步骤2)中,TALEN的其中一条臂或CRISPR/Cas9的gRNA 覆盖插入特定序列的位点或与欲删除序列部分或完全重叠,使donorDNA模板上不存在 TALEN或CRISPR/Cas9的结合位点。
3.权利要求1或2所述的方法,当步骤4)完成后,如果一个等位基因发生了符合 预期的突变,而另一个等位基因未发生改变,重复进行上述步骤3)和步骤4),至筛选出 两个等位基因均发生预期突变的细胞株。
4.权利要求1或2所述的方法,当步骤4)完成后,如果发现一个等位基因发生了 符合预期的突变,而另一个等位基因发生了非预期的突变时,针对所突变的等位基因重新 设计TELEN或CRISPR/Cas9,然后重复进行上述步骤3)和步骤4)操作,至筛选出两个 等位基因均发生预期突变的细胞株。
5.一种获得基因组DNA双等位基因相同突变的方法,按权利要求4所述方法操作, 至筛选出两个等位基因均发生相同预期突变的细胞株。
6.权利要求1或2所述的方法,DNA序列精准编辑的位点选自整个基因组任意位点。
7.权利要求1或2所述的方法在基因组DNA序列改造中的应用。
8.权利要求7所述的应用,所述基因组DNA序列改造,是在整个基因组的任意位点 定点并无缝隙地插入或删除基因组中特定的碱基序列,且不留下任何无关的基因或碱基序 列。
9.一种DNA在缺失突变时的自身修复方法,首先利用重叠延伸(overlapextension) PCR技术,获得含相关同源序列和突变内容的donorDNA,然后将其连同与针对该序列设 计的TALEN或CRISPR/Cas9一起转染到操作细胞内,后者导致DNA双链断开,部分断 开处两侧的5’到3’断端将与donorDNA发生退火,并以donorDNA为模板合成延伸,然 后离开donorDNA模板,相互退火在一起,从而即可获得与donorDNA中所设计的突变 内容相同的突变。
10.CD195基因DNA序列精准编辑方法,首先利用重叠延伸PCR技术,获得donor DNA,然后将其与针对CD195基因特定位点设计的TALEN质粒对电转入U87细胞内, 导致欲删除32个碱基序列附近DNA双链断裂,并在自然修复的过程中发生donorDNA 与野生型CD195基因之间同源重组,从而获得CD195delta32突变基因;所述donorDNA 是一段含有CD195delta32的基因片段。
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