[发明专利]用于高通量测序的DNA建库方法在审
申请号: | 201610046746.5 | 申请日: | 2016-01-22 |
公开(公告)号: | CN105568393A | 公开(公告)日: | 2016-05-11 |
发明(设计)人: | 赵明玉;陈威 | 申请(专利权)人: | 北京圣谷同创科技发展有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06 |
代理公司: | 北京中政联科专利代理事务所(普通合伙) 11489 | 代理人: | 柴智敏 |
地址: | 100089 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 通量 dna 方法 | ||
1.用于高通量测序的DNA建库方法,包括以下步骤:
1)多重PCR
将分离纯化的DNA进行多重PCR扩增,反应体系为:
多重PCR反应条件为:99℃保持2min,然后进行23个循环,每个循环为99℃15s、60℃ 4min,然后保持在10℃;
2)引物部分裂解
将1μlFuPaReagent加入到PCR产物中混匀后,在PCR仪中依次按下述条件运行:50℃ 10min,55℃10min,60℃20min,然后保持在10℃;
3)接头的连接和纯化
向步骤2)得到的反应产物中加入2μl的7.5XSwitchSolution、1μl的Barcode Adapter、1μlDNALigase,在PCR仪中依次按下述条件运行:22℃30min,72℃10min,然后保 持在10℃;
向上述反应产物中加入22.5μlAgencourtAMPureXP混匀后室温孵育5min,置于磁力 架上,溶液澄清后弃尽上清,使用200μl新鲜的70%乙醇清洗磁珠两次,分别弃掉上清,短暂 离心后放回磁力架上,吸尽残余液体,室温干燥5分钟后,分别加入25μL的PlatinumPCR SuperMixHighFidelity和1μL的LibraryAmplificationPrimer,混匀后,重新放回磁力 架,待溶液澄清后,取上清;
4)扩增以及扩增后纯化
将步骤3)中获得的上清按照以下反应条件进行扩增:在98℃保持2min,然后进行7个循 环,每个循环为98℃15s、60℃1min,然后保持在10℃;
在扩增产物中加入30μlAgencourtAMPureXP,混匀,室温放置5min后,置于磁力架 上,直到溶液澄清后,弃掉上清,使用200μl新鲜的70%乙醇清洗磁珠两次,分别弃掉上清, 短暂离心后放回磁力架上,吸尽残余液体,室温干燥5分钟。
2.根据权利要求1的方法,进一步包括:将在上述步骤4)获得干燥产物中加入20μl的无 核酸水进行洗脱,混匀后将离心管放到磁力架上,溶液澄清后,取上清。
3.根据权利要求2的方法,使用所述上清进行文库浓度的测定以及质控。
4.根据权利要求1-3任一项的方法,其中所述DNA是cfDNA。
5.根据权利要求4的方法,其中所述cfDNA是血浆cfDNA。
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