[发明专利]一种在血浆和血清中检测miRNA的方法在审
申请号: | 201610061103.8 | 申请日: | 2016-01-28 |
公开(公告)号: | CN107012199A | 公开(公告)日: | 2017-08-04 |
发明(设计)人: | 俞作仁;赵倩;王光学;梁春立 | 申请(专利权)人: | 上海市东方医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司31266 | 代理人: | 崔佳佳,马莉华 |
地址: | 200120 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 血浆 血清 检测 mirna 方法 | ||
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体地,涉及一种在血浆和血清中检测miRNA的方法。
背景技术
2008年Mitchell PS等发现血浆中miRNA能以稳定的形式存在,避免内源性RNA酶的降解。同年Shlomit G等证实miRNA可以在血浆和其他体液中稳定存在,并且表达谱随不同病理生理状态而改变。由于外周静脉血获取简单且病人容易接受,克服了样本量不足等困难,使得循环miRNA在疾病诊断中的应用研究成为研究的热点。
最常用且有效的miRNA表达检测技术是荧光定量PCR法。目前通用步骤为:抽提样本RNA,逆转为miRNA cDNA,荧光定量检测miRNA表达水平。第一步抽提样本RNA较困难。由于血浆miRNA含量较低,若样本量较少时提取的RNA量不足后续试验。最常用的血浆循环RNA抽提法沿用传统TriZol抽提法:TriZol裂解,氯仿萃取,异丙醇沉淀,75%乙醇洗涤,DEPC水溶解。此方法提取效率低,对样本量要求大,而且有机试剂的残留会抑制后续PCR反应,造成miRNA检测效率下降。市场上的试剂盒抽提法为:裂解,萃取,磁珠或吸附柱吸附,洗涤,溶解。该方法通常会使用磁珠或吸附柱,会造成RNA的损失、破坏RNA的完整性,对样本需求量大而且费用较高。
并且,传统的血浆miRNA检测方法复杂,耗时间,成本高,重复性低,不利于临床推广和应用。
因此,本领域迫切需要开发一种简化检测方法、降低成本、提高重复性的在血浆和血清中检测miRNA的方法。
发明内容
本发明的目的是提供了一种简化检测方法、降低成本、提高重复性的在血浆和血清中检测miRNA的方法。
本发明第一方面提供了一种非诊断性的免抽提的对测试样品进行miRNA检测的方法,所述方法包括步骤:
(i)提供一测试样品,所述测试样品为血浆和血清样品,将所述测试样品和预处理缓冲液混合,形成第一混合物,其中所述预处理缓冲液包括非离子型表面活性剂;
(ii)将所述第一混合物进行加热处理,得到经处理的第二混合物;和
(iii)将所述第二混合物直接用作模板,检测所述测试样品中的miRNA的种类和/或含量。
在另一优选例中,在步骤(i)中,所述预处理缓冲液包括一种或多种选自下组的非离子型表面活性剂:吐温20(TWEEN-20)、吐温21(TWEEN-21)、吐温40(TWEEN-40)、吐温60(TWEEN-60)、吐温61(TWEEN-61)、吐温80(TWEEN-80)、吐温81(TWEEN-81)、吐温85(TWEEN-85)、Triton X-100、NP-40、或其组合。
在另一优选例中,所述非离子型表面活性剂包括吐温20(TWEEN-20)。
在另一优选例中,所述非离子型表面活性剂的浓度(V/V)为0.5-10%,较佳地,1-5%,更佳地,2-4%。
在另一优选例中,所用溶剂为水。
在另一优选例中,所述非离子型表面活性剂的浓度为0.5-10wt%,较佳地,1-5wt%,更佳地,2-4wt%。
在另一优选例中,在步骤(i)中,所述预处理缓冲液的pH为6-9,较佳地,7-9,更佳地,7-8。
在另一优选例中,所述预处理缓冲液还包括Tris-HCl缓冲液。
在另一优选例中,所述Tris-HCl缓冲液的浓度为25-150mM,较佳地,30-100mM,更佳地,30-80mM。
在另一优选例中,所述预处理缓冲液还包括金属螯合剂。
在另一优选例中,所述金属螯合剂选自下组:EDTA、EGTA、或其组合。
在另一优选例中,所述金属螯合剂包括EDTA。
在另一优选例中,所述金属螯合剂的浓度为0.5-2.0mM,较佳地,0.5-1.5mM,更佳地,0.8-1.2mM。
在另一优选例中,在步骤(ii)中,所述加热温度为60-80℃,较佳地,70-75 ℃。
在另一优选例中,在步骤(iii)中,用荧光定量PCR的方法检测测试样品中的miRNA的含量。
在另一优选例中,所述miRNA来自于哺乳动物,优选人。
在另一优选例中,所述方法不包括抽提RNA的步骤。
在另一优选例中,所述方法为非治疗非诊断性的。
在另一优选例中,所述方法检测所述测试样品中选自下组(A)的一个或多个miRNA的种类和/或数量:miR-20b、miR-106a、miR-16。
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