[发明专利]一种进行固相PCR反应的自动化微流工作站及方法在审
申请号: | 201610061168.2 | 申请日: | 2016-01-28 |
公开(公告)号: | CN105505766A | 公开(公告)日: | 2016-04-20 |
发明(设计)人: | 张一桐;李鹏鑫;张祥林;胡秋萍;于丹;陈勇 | 申请(专利权)人: | 上海美吉逾华生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12M1/38 | 分类号: | C12M1/38;C12N15/10 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 胡晶 |
地址: | 201023 上海市浦东新*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 进行 pcr 反应 自动化 工作站 方法 | ||
1.一种自动进行固相PCR反应的微流工作站,所述工作站包括:
至少一个微流控芯片,芯片含有一个或多个独立的反应通道,每一反应通道包括进出口、 一个或多个串联或并联的反应腔室和/或流道,反应腔室底面锚定有寡核苷酸序列,以进行 固相PCR扩增和/或固相单碱基延伸反应;
液路系统,以控制引入不同反应试剂溶液流至对应的反应腔室;
温控装置,以控制调节所述反应腔室内的温度;
控制系统,其连接上述液路系统和温控装置,用于控制液路系统和温控装置,在微流控 芯片的反应腔室内进行的固相PCR扩增和固相单碱基延伸反应,并包括变性-洗脱反应和洗 脱-变性反应。
2.根据权利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述微流控芯片包括上盖、反应 通道和基底,上盖设有反应通道的进出口,基底进行刻蚀挖槽成反应通道,通道长度为 2-8cm,深度为50um-200um,宽度为0.5mm~3mm,单个反应通道的反应体系总体积为 5ul~20ul。
3.根据权利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述微流控芯片包括上盖、通道 栅栏和基底,上盖设有反应通道的进出口,上盖-通道栅栏-基底的“三明治结构”形成多个 独立的反应通道。
4.根据权利要求2和3所述的微流控芯片,其特征在于,通过对分层结构的键合封装, 形成可进出流通的封闭反应腔室。
5.根据权利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述微流控芯片材质为包括金属、 玻璃、硅片和聚合物的至少一种或组合组成,其容纳流体的有效结构至少在一个维度上为微 米级尺度,微流控芯片处于多个的状态下,各个微流控芯片分别独立与控制系统连接。
6.根据权利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述微流控芯片的固相衬底为平 面结构,可锚定高密度的一种或多种寡核苷酸序列,所述固相衬底平铺锚定寡核苷酸序列是 通过羧基/醛基/环氧基-氨基、链霉亲和素-生物素在内的多种化学修饰中的至少一种完成。
7.根据权利要求6所述的微流工作站,其特征在于,所述锚定在芯片通道底面的寡核 苷酸序列是PCR扩增所需的反向引物。
8.根据权利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述的固相单碱基延伸反应包括 发生一个或多个退火-延伸反应。
9.根据权利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述温控装置设置在芯片反应腔 室的底面。
10.根据权利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述液路系统包括设置各种所述 试剂的容器、与反应通道相连的通路及控制阀,所述试剂包括用于PCR扩增的正向引物/单 碱基延伸引物、脱氧核糖核苷三磷酸/双脱氧核糖核苷三磷酸、反应酶、反应缓冲液和清洗 缓冲液在内,控制系统与此控制阀相连接,以控制阀门的开关或通路流量的大小。
11.根据权利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述控制系统包括电力提供装置、 控制器、采集器、显示装置和/或输出装置,电力提供装置给微流工作站提供电力,控制器 连接采集器,显示装置和/或输出装置,并连接液路系统和温控装置。
12.一种基于权利要求1所述的基于微流控芯片实现固相PCR反应的方法,其特征在 于,包括以下步骤:
A:在微流控芯片的每一反应通道的固相衬底上发生固相PCR扩增反应;
B:在经过变性处理及洗脱后,目标单链DNA片段固定在固相衬底;
C:进行固相单碱基延伸反应,并对延伸产物进行提纯分离。
13.根据权利要求12所述的方法,其特征在于,步骤A进一步包括:
控制系统将含有PCR反应液、dNTP、DNA模板/全血、正向引物在内的混合液由液路系 统引入固相衬底锚定连接有反向引物的反应腔室,
控制系统控制温控系统在经过若干次的变性、退火、延伸后生成含有反向引物的目标单 链DNA和含有正向引物的互补单链DNA,两条单链DNA可互补生成双链DNA,并通过反向 引物固定在通道底面。
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