[发明专利]一种马铃薯Y病毒属病毒中和表位鉴定方法及其应用在审
申请号: | 201610070080.7 | 申请日: | 2016-02-01 |
公开(公告)号: | CN105588942A | 公开(公告)日: | 2016-05-18 |
发明(设计)人: | 王永志;苏颖;李启云;李小宇;张春雨 | 申请(专利权)人: | 吉林省农业科学院 |
主分类号: | G01N33/577 | 分类号: | G01N33/577;G01N33/569 |
代理公司: | 北京国智京通知识产权代理有限公司 11501 | 代理人: | 孙文彬 |
地址: | 130000 吉林省长*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 马铃薯 病毒 中和 鉴定 方法 及其 应用 | ||
1.一种马铃薯Y病毒属病毒中和表位鉴定方法及其应用,其特 征在于,该鉴定方法包括以下步骤:
S1,准备材料:准备好实验室保存的大肠杆菌DH5α菌株、Rosseta 菌株、大豆花叶病毒和马铃薯Y病毒等马铃薯Y病毒属代表毒株、 SP2/0细胞,BALB/c小鼠,购自大连宝生物公司的限制性内切酶、反 转录酶、T4DNA连接酶、EX-TagDNA聚合酶,购自美国GE公司的异 丙基-β-D-硫代半乳糖苷、Ni2+离子亲和层析柱,购自Sigma公司的 HRP标记的羊抗鼠酶标抗体;
S2,马铃薯Y病毒属衣壳蛋白(CP)基因的克隆:根据GenBank 中已有的马铃薯Y病毒属基因序列设计CP基因的特异性引物,以 TRIzol法抽提病毒感染植物组织总RNA,用M-MuLV反转录酶42℃ 作用1h合成cDNA第一链,以此为模板用EX-TaqDNA聚合酶扩增CP 基因,其中的反应条件为94-95℃预变性1-3min;93-95℃变性 15-20s,56℃退火30s,72℃延伸50s,进行30个循环;72℃再延伸 10min,PCR产物经凝胶纯化回收,与pMD18-T载体连接,转化大肠 杆菌DH5α感受态细胞,构建重组质粒pMD-CP;
S3,原核表达载体的构建:NcoⅠ和XhoⅠ双酶切重组质粒pMD-CP 和原核表达载体pET-28a(+),凝胶纯化回收目的片段,将CP基因与 pET-28a(+)连接,构建重组质粒pET28a-CP,分别转化大肠杆菌 DH5α,经PCR鉴定和酶切鉴定后,进行测序;
S4,重组CP蛋白的鉴定:将重组质粒pET28a-CP转化至大肠杆 菌BL21,挑取单个菌落进行鉴定后扩增繁殖,采用不同的IPTG浓度、
诱导时间、诱导温度、菌液浓度、培养基抗生素浓度进行诱导表 达,优化诱导条件,比较不同表达载体以及不同表达条件的表达量, 确定最佳诱导条件,同时设立含pET-28a(+)空载体的表达菌作为 对照;
S5,重组CP蛋白的纯化:采用优化的表达条件进行大量表达, 收获菌体,冻融3次,用PBS悬浮菌体沉淀,在3-5℃的条件下 4500r/min离心9-11min,包涵体沉淀用3mol/L尿素溶液洗去大部分 杂蛋白,在4℃的条件下4500r/min离心10min,包涵体沉淀用pH=8.0 含8mol/L尿素的裂解液室温溶解1h,在4℃的条件下12000r/min离 心20min,取上清蛋白与Ni2+-NTA填料结合0.5-1.5h,分别用pH=8.0、 6.3、5.9的8mol/L尿素溶液洗涤去杂蛋白后,用pH=4.5的8mol/L 尿素溶液洗脱目的蛋白,收集洗脱的目的蛋白,进行SDS-PAGE鉴定;
S6,CP蛋白单克隆抗体制备和病毒中和试验:对CP蛋白进行单 克隆抗体制备,配制1mg/ml浓度的单克隆抗体溶液;按1:20(克: 毫升)取发病叶与PBS溶液混合,用匀浆器制成病毒混悬液,3000rpm 离心4-6min,上清即为病毒液,100ml病毒液加入1mg抗体,然后通 过叶片摩擦接毒,观察发病情况,确定抗体中和活性;
S7,中和表位分析:将CP蛋白等分成3个区域,分别是A、B、 C区,每个区域约89个aa,将CP蛋白分成两个多肽,分别是CP-AB 和CP-BC,用大肠杆菌表达,用CP蛋白的单克隆抗体分别与CP-AB 和CP-BC试验;若与CP-AB反应,而不与CP-BC反应,说明该抗体识 别的抗原表位位于CP蛋白的A区;若与CP-AB和CP-BC都反应,说 明该抗体识别的抗原表位位于CP蛋白的B区;若与CP-AB不反应, 而与CP-BC反应,说明该抗体识别的抗原表位位于CP蛋白的C区。 这样,分别将10株单克隆抗体所识别的抗原表位定位在3个不同的 区域内,在确定抗原表位定位到具体的分区后,将该分区分成相互重 叠多肽,每个多肽有16个氨基酸残基,相邻多肽之间有8个氨基酸 残基的重叠,通过ELISA分析,将抗原表位定位在16个氨基酸残基 之内。
2.根据权利要求1所述的一种马铃薯Y病毒属病毒中和表位鉴 定方法及其应用,其特征在于,所述S7中,将CP蛋白等分成3个区 域,分别是A、B、C区,每个区域约89个氨基酸,将CP蛋白分成两 个多肽,分别是CP-AB和CP-BC,用大肠杆菌表达,用具有中和活性 的CP蛋白的单克隆抗体分别与CP-AB和CP-BC试验;若与CP-AB反 应,而不与CP-BC反应,说明该抗体识别的抗原表位位于CP蛋白的 A区;若与CP-AB和CP-BC都反应,说明该抗体识别的抗原表位位于 CP蛋白的B区;若与CP-AB不反应,而与CP-BC反应,说明该抗体 识别的抗原表位位于CP蛋白的C区。这样,分别将10株单克隆抗体 所识别的抗原表位定位在3个不同的区域内,在确定抗原表位定位到 具体的分区后,将该分区分成相互重叠多肽,每个多肽有16个氨基 酸残基,相邻多肽之间有8个氨基酸残基的重叠,通过ELISA分析, 将抗原表位定位在16个氨基酸残基之内。
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