[发明专利]基于21个线粒体SNP位点的法医学快速检测试剂盒有效
申请号: | 201610076872.5 | 申请日: | 2016-02-03 |
公开(公告)号: | CN105543388B | 公开(公告)日: | 2018-07-31 |
发明(设计)人: | 严江伟;杨雅冉;杨猛;陈婧 | 申请(专利权)人: | 中国科学院北京基因组研究所 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100101 北京市朝阳区北辰*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 21 线粒体 snp 法医学 快速 检测 试剂盒 | ||
1.一种基于21个线粒体SNP位点的法医学快速检测试剂盒,其特征在于:所述的法医学快速检测试剂盒包括⑴富集引物的混合物,⑵21条单碱基延伸引物混合物,⑶扩增试剂:dNTPs和快速Taq聚合酶,⑷核酸纯化柱,⑸SNaPshot反应混合液,⑹Hi-Di甲酰胺,⑺GeneScanTM Size Standards-120LIZ,⑻阳性对照:DNA 9947A,⑼阴性对照:ddH2O;
所述的富集引物的混合物包括用于扩增线粒体nt25~343、nt365~675、nt16132~16552、nt8158~8488、nt8504~8808和nt10285~10682六个区域的6对富集引物;所述的6对富集引物的序列及工作浓度为:
SEQ ID NO:1,0.31μM SEQ ID NO:2,0.32μM
SEQ ID NO:3,0.30μM SEQ ID NO:4,0.30μM
SEQ ID NO:5,0.36μM SEQ ID NO:6,0.34μM
SEQ ID NO:7,0.31μM SEQ ID NO:8,0.33μM
SEQ ID NO:9,0.32μM SEQ ID NO:10,0.30μM
SEQ ID NO:11,0.34μM SEQ ID NO:12,0.33μM;
所述的21条单碱基延伸引物的序列及工作浓度为:
SEQ ID NO:13,0.21μM SEQ ID NO:14,0.20μM
SEQ ID NO:15,0.22μM SEQ ID NO:16,0.20μM
SEQ ID NO:17,0.20μM SEQ ID NO:18,0.23μM
SEQ ID NO:19,0.25μM SEQ ID NO:20,0.23μM
SEQ ID NO:21,0.20μM SEQ ID NO:22,0.21μM
SEQ ID NO:23,0.22μM SEQ ID NO:24,0.25μM
SEQ ID NO:25,0.20μM SEQ ID NO:26,0.20μM
SEQ ID NO:27,0.21μM SEQ ID NO:28,0.23μM
SEQ ID NO:29,0.22μM SEQ ID NO:30,0.23μM
SEQ ID NO:31,0.23μM SEQ ID NO:32,0.21μM
SEQ ID NO:33,0.25μM。
2.如权利要求1项所述的法医学快速检测试剂盒在案件排查、个体识别以及尸源认定中的应用。
3.利用权利要求1所述的快速检测试剂盒进行个体识别检测的使用方法, 其特征在于:所述的使用方法包括以下步骤:
⑴.线粒体DNA提取:从待测生物检材中提取线粒体DNA;
⑵.复合扩增反应:取步骤⑴所得的线粒体DNA作为复合扩增模版,加入富集引物的混合物和扩增试剂,进行单管内复合扩增反应,PCR扩增程序为:94℃预变性5min,94℃变性15s, 55℃退火5s,72℃延伸10s,共30个循环,最后72℃延伸2min,获得复合扩增产物;
⑶.复合扩增产物纯化:用核酸纯化柱纯化步骤⑵所得的复合扩增产物;
⑷.单碱基延伸反应:取步骤⑶所得的纯化后的复合扩增产物,加入单碱基延伸引物混合物和SNaPshot反应混合液,进行单管内单碱基延伸反应,单碱基延伸反应程序为:96℃10s,50℃5s,60℃30s,共20个循环,获得单碱基延伸产物;
⑸.电泳:取步骤⑷所得的单碱基延伸产物,加入Hi-Di甲酰胺、GeneScanTM SizeStandards-120LIZ,混合均匀后,于95℃变性3min,4℃迅速冷却后进行荧光电泳检测和基因型分析。
4.如权利要求3所述的使用方法,其特征在于:所述的使用方法步骤⑷中SNaPshot反应混合液的加入量为1~1.5μL;所述的单碱基延伸反应的总体积为5μL。
5.如权利要求3或4所述的使用方法,其特征在于:所述的使用方法步骤⑷中的纯化后的复合扩增产物的加入量为1~5ng。
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