[发明专利]一种用于鉴定糯玉米沪五彩花糯1号的SNP分子标记及其鉴定方法有效
申请号: | 201610086080.6 | 申请日: | 2016-02-15 |
公开(公告)号: | CN105483281B | 公开(公告)日: | 2018-08-24 |
发明(设计)人: | 李全林;沈雪芳;袁政;韩晴;张大兵;卢媛;王义发 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院;上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 上海开祺知识产权代理有限公司 31114 | 代理人: | 费开逵 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴定 玉米 五彩 snp 分子 标记 及其 方法 | ||
1.一种用于鉴定糯玉米沪五彩花糯1号的SNP分子标记,所述SNP分子标记包括分子标记SNP1-SNP9,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1-9所示,具体如下:
2.一种用于鉴定糯玉米沪五彩花糯1号的特异引物对,其特征在于,所述特异引物对包括引物对组合1-9,每个引物对组合均含有两个引物对,其核苷酸序列如下:
3.一种基于SNP分子标记的糯玉米沪五彩花糯1号的鉴定方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)根据权利要求1所述的SNP分子标记分别设计如权利要求2所述的引物对组合1-9;
2)提取待鉴定品种的基因组DNA;
3)根据所述引物对组合1-9分别对待鉴定品种的基因组DNA进行PCR扩增;
4)对PCR扩增产物进行多态性鉴定
对步骤3)得到的扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,根据指纹图谱结果判定:若扩增产物的指纹图谱结果与下述结果完全一致,则待鉴定品种为糯玉米沪五彩花糯1号:
引物对组合1:第1引物对的扩增产物指纹图谱:出现124bp条带;
第2引物对的扩增产物指纹图谱:出现143bp条带;
引物对组合2:第1引物对的扩增产物指纹图谱:出现130bp条带;
第2引物对的扩增产物指纹图谱:出现149bp条带;
引物对组合3:第1引物对的扩增产物指纹图谱:出现294bp条带;
第2引物对的扩增产物指纹图谱:出现313bp条带;
引物对组合4:第1引物对的扩增产物指纹图谱:出现323bp条带;
第2引物对的扩增产物指纹图谱:出现342bp条带;
引物对组合5:第1引物对的扩增产物指纹图谱:出现101bp条带;
第2引物对的扩增产物指纹图谱:出现120bp条带;
引物对组合6:第1引物对的扩增产物指纹图谱:出现134bp条带;
第2引物对的扩增产物指纹图谱:出现153bp条带;
引物对组合7:第1引物对的扩增产物指纹图谱:出现207bp条带;
第2引物对的扩增产物指纹图谱:出现226bp条带;
引物对组合8:第1引物对的扩增产物指纹图谱:出现131bp条带;
第2引物对的扩增产物指纹图谱:出现150bp条带;
和引物对组合9:第1引物对的扩增产物指纹图谱:出现220bp条带;第2引物对的扩增产物指纹图谱:出现239bp条带。
4.如权利要求1所述SNP分子标记在鉴定糯玉米沪五彩花糯1号中的应用。
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