[发明专利]一种检测染色体16p11.2微缺失的产品

说明书

本发明公开了一种检测染色体16p11.2上29.5‑30.1Mb区域内0.6Mb微缺失的方法，所述方法的检测原理是：利用多个SNP位点基因型纯合比乘积的小概率事件来判断是否存在染色体微缺失。另外，本发明还公开了一种检测染色体16p11.2上29.5‑30.1Mb区域内0.6Mb微缺失的产品，同时该产品还能检测受试者是否患有先天性脊柱侧凸。本发明的检测方法和检测产品在临床上具有广泛的应用前景。

技术背景

本发明属于分子遗传学领域，涉及一种检测染色体微缺失的产品。

背景技术

染色体微缺失是由微小的、传统细胞遗传学分析难以发现的染色体畸变而导致的具有复杂临床表现的遗传性疾病。畸变小于5MB，是基因组疾病中最常见的类型。目前至少发现67余种，发病率1/4000-50000，常见的临床表型为生长发育异常、智力发育迟缓、特殊面容、内脏器官畸形、内分泌异常、精神行为改变。

人类染色体16p11.2上29.5-30.1Mb区域内大约0.6Mb的缺失是人类的罕见突变，其突变频率大约是0.02％。该缺失能够引起神经发育相关疾病(例如，孤独症和肥胖)。有趣的是，近来在一小部分16p11.2微缺失的病人中发现了CS的表型，表明16p11.2微缺失可能参与了CS的发病机制。虽然CS往往是在婴儿或幼儿时期发现，但也有许多患儿直到他们的青少年时期才表现出来。由于诊断常识和诊断手段缺乏等原因，病变常为家长和医生忽视，直至畸形发展明显后才被发现。现在诊断先天性脊柱侧凸常用的方法包括X线、MRI等，但这些方法只适用于病变明显的患者使用，对于那些潜在的还未有明显表型的患者并不适用。

申请人所在课题组经过研究发现人类染色体16p11.2微缺失与CS显著相关，通过检测人类染色体16p11.2微缺失可以判断受试者是否患有CS或者判断受试者患有CS的风险高低。传统鉴定染色体微缺失的方法包括比较基因组杂交(CGH)和阵列-CGH(array-CGH)技术，当缺失的染色体片段较小时，用传统的核型分析无法检测。比较经典的检测方法是荧光原位分子杂交(FISH)，但费用较高，较为费时，因此建立一种既经济又操作简便的染色体微缺失的方法是亟待解决的问题。

发明内容

为了解决现有技术中存在的问题，本发明的目的在于提供一种检测染色体16p11.2上29.5-30.1Mb区域内0.6Mb微缺失的方法。相比于现有技术，本发明检测染色体微缺失的方法存在明显的优势-操作简单、省时、费用低，准确度高，能够检测长片段的微缺失。

本发明的目的之二在于提供一种检测染色体微缺失的试剂盒。所述试剂盒通过检测染色体16p11.2上29.5-30.1Mb区域内0.6Mb微缺失区域内存在的SNP位点的基因型来判断是否存在染色体微缺失。

为了达到本发明的上述目的，本发明采用了如下技术方案：

本发明提供了一种检测染色体16p11.2上29.5-30.1Mb区域内0.6Mb微缺失的方法，所述方法包括如下步骤：

(1)提取样本基因组DNA；

(2)选取所述染色体微缺失内的基因上的SNP位点，所述基因至少为20个基因且在核苷酸微缺失区域内均匀分布；每一个所述基因上选取至少一个SNP位点，所述至少20个SNP位点在核苷酸微缺失区域内均匀分布且所述至少20个SNP位点的人群纯合比的乘积小于等于一百万分之十四；

(3)检测步骤(2)选取的所述SNP位点的基因型；如果所述SNP位点的基因型均为纯合型，则判断该样本基因组DNA中存在染色体16p11.2上0.6Mb微缺失。