[发明专利]大豆百粒重主效QTL的分子标记InDeL_33及其应用

说明书

本发明公开了大豆百粒重主效QTL的分子标记InDeL_33及其应用。本发明大豆百粒重主效QTL位点位于大豆第11号染色体Gm11:2261898bp‑6577664bp；所述分子标记InDel_33的上游引物序列为Seq ID NO.1，下游引物序列为Seq ID NO.2。在构建的次级群体中，以待测F₂单株基因组DNA为模板，InDel_33引物对进行PCR扩增，检测扩增产物，扩增产物中具有一个大小为120bp特异DNA片段的待测材料为候选的小粒大豆材料。利用本发明的分子标记可以简便快捷的筛选大粒、小粒大豆材料，可以加快小粒大豆育种进程。

技术领域

本发明涉及大豆分子标记辅助育种，属于大豆遗传育种领域，具体涉及大豆百粒重主效QTL的分子标记InDeL_33及其应用。

背景技术

大豆百粒重是衡量大豆籽粒大小的重要指标之一，是构成产量的重要因素。大豆百粒重的变异幅度很大，栽培大豆的百粒重通常在6～55g之间，野生大豆的百粒重一般在1～3g之间。百粒重在12g以下的一般统称为小粒大豆。小粒大豆较大粒大豆而言，具有高蛋白质，高不饱和脂肪酸、粗纤维，高钙、锌含量，低脂肪、糖，亚麻酸亚油酸配比合适等优势，因此可作为芽豆和纳豆的理想加工原料脱颖而出。

大豆豆芽是利用大豆种子经水浸后生发出嫩芽的一种特定意义的蔬菜，具有重要的食用和保健价值。纳豆食品是用枯草杆菌或细豆菌发酵大豆而制成的一种功能性食品，其富含氨基酸、有化酸、寡糖及生理活性物质，具有保键功能，市场潜力巨大。

国外的一些研究人员非常重视适用于豆芽生产的小粒大豆品种的选育。其中以韩国、美国和日本最为突出，韩国用于豆芽生产的品种要求百粒重在l0g左右，美国也育成了Mercury，IL1、IL2、Minnatoo等豆芽和纳豆兼用的大豆专用品种。国内在大豆专用品种的选育工作上还比较薄弱，但随着人们对豆芽和纳豆消费需求的扩大，相应的小粒大豆品种选育工作也日益受到重视。

为了加快豆芽、纳豆专用小粒大豆品种的选育进程，彻底摆脱小粒大豆专用品种资源匮乏的局面，需要进一步明确育种目标，筛选鉴定优良亲本材料，组配优势杂交组合，利用分子标记后代鉴定，挖掘出控制大豆籽粒性状的主效QTL/基因，解析其遗传变异，探究其功能机制，为今后充分利用小粒大豆基因资源成功开展小粒专用大豆分子标记辅助选择育种奠定基础。

野生大豆是栽培大豆的近缘野生种，具有极强的抗逆性，是大豆育种极为重要的种质资源，充分利用野生大豆优异基因资源改良栽培大豆，对拓宽大豆种质资源具有重要意义。国内外研究者通过釆用不同的分子标记对大豆种质资源遗传多样性进行了分析，分析结果表明小粒大豆有野生大豆的血缘，具有适应性广、抗逆性强等特点。因此通过构建栽培×野生大豆重组自交系群体研究大豆籽粒性状遗传变异，挖掘出控制百粒重主效QTL/基因，开发紧密连锁的分子标记，对有效选育小粒大豆品种具有十分重要的生产应用价值。

利用分子标记定位数量性状QTL，其实质就是以Morgan遗传连锁定律为依据，统计分析具有多态性分子标记和数量性状表型间的关系，继而分析标记和目标性状QTL的连锁关系，利用已知位置的分子标记来定位未知位置的QTL，紧密连锁的分子标记可应用于分子标记辅助选择(MAS)育种。

MAS育种核心是找到与性状紧密连锁的分子标记。通过构建栽培×野生重组自交系群体，进行百粒重QTL初定位，检测控制百粒重主效QTL，在其衍生的次级群体中对主效QTL验证并精细定位，开发与主效QTL紧密连锁的分子标记，应用于有效选育小粒大豆品种中。

发明内容

本发明的目的是提供大豆百粒重主效QTL紧密连锁的分子标记InDeL_33。

本发明的另一目的是提供该分子标记的引物对。

本发明的又一个目的是提供该大豆百粒重主效QTL的分子标记InDeL_33或其引物对在检测所述的大豆百粒重主效QTL及选育小粒大豆品种中的应用。