[发明专利]定量检测胶质瘤中HERC2P2表达量的方法在审
申请号: | 201610119988.2 | 申请日: | 2016-03-03 |
公开(公告)号: | CN105671162A | 公开(公告)日: | 2016-06-15 |
发明(设计)人: | 康春生;王琦雪;韩磊;周俊虎 | 申请(专利权)人: | 天津医科大学总医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 天津市宗欣专利商标代理有限公司 12103 | 代理人: | 董光仁 |
地址: | 300052 *** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 定量 检测 胶质 herc2p2 表达 方法 | ||
技术领域
本发明属于核酸的测定和检测方法领域,具体是一种定量检测胶质瘤中HERC2P2 表达量的方法。
背景技术
长链非编码RNA(longnon-codingRNA,lncRNA)是近年来发现的RNA家族重 要成员,是指长度在200nt以上,并且不编码蛋白的RNA。最初,这些非编码的转录本被认为 是“暗物质”或“噪音”。近年来,随着RNA研究技术和水平的不断提高,人们发现非编码RNA在 生物体中发挥着十分重要的功能。LncRNA能够参与免疫系统的调控,X染色体的沉默,蛋白 质功能的调控等一系列生理功能。近期发现,HERC2P2也是一个lncRNA,位于15号染色体 上,是HERC2的假基因,共有6075个碱基,其与肿瘤的关系也十分密切。所以定量测定 HERC2P2的表达量对肿瘤的预防和治疗具有重要的临床意义。
Taqman探针法是高度特异性的定量PCR技术。其核心是利用Taq酶的3’-5’外切酶活性, 切断探针,产生荧光信号。由于探针与模板是特异性结合,所以荧光信号的强弱就代表了模 板的数量。
在Taqman探针法的定量PCR反应体系中,包括一对PCR引物和一条探针。探针只与 模板特异性结合,其结合位点在两条引物之前。探针的5’端标记有报告基团(Reporter,R), 如FAM,VIC等,3’端标记有荧光淬灭基团(Quencher,Q),如TAMRA等。当探针完整的时候,报 告基团所发射的荧光能量被淬灭基团吸收,仪器检测不到信号。随着PCR的进行,Taqman酶 在链延伸过程中遇到与模板结合的探针,其3’-5’外切核酸酶活性就会将探针切断,报告 基因远离淬灭基团,其能量不能被吸收,及产生荧光信号。所以,每经过一个PCR循环,荧光 信号也和目的片段一样,有一个同步指数增长的过程,信号强度就代表了模板DNA的拷贝 数。
普通的SYBRGreenRealTimePCR,荧光染料非特异性的结合在双链DNA上,容易 受到非特异性扩增和引物二聚体的影响,而Taqman探针法能够显著提高PCR检测的灵敏性 和准确度。并且还能够利用多种荧光同时进行多重分析,这也是普通SYBR等DNA结合荧光基 团所不具备的。
发明内容
本发明就是为了填补定量检测HERC2P2表达量方法领域的空白,所提出的一种定 量检测胶质瘤中HERC2P2表达量的方法。
本发明是按照以下技术方案实现的。
一种用于定量检测胶质瘤中HERC2P2表达量的探针和引物,上游引物的核酸序列 如SeqIDNO.1所示;下游引物的核酸序列如SeqIDNO.2所示;Taqman探针核酸序列如 SeqIDNO.3所示。
一种应用上述的探针和引物定量检测胶质瘤中HERC2P2表达量的方法,包括以下 步骤:
a.检测样本RNA的提取;
b.将步骤a中获得RNA逆转录为cDNA;
c.以步骤b中获得的cDNA为模板,应用权利要求1所述的引物和探针,进行荧光定量 PCR,测定样本中HERC2P2表达量。
本发明获得了如下的有益效果。
本发明有效的填补定量检测HERC2P2表达量方法领域的空白,能够快速、精确、有 效的检测胶质瘤中HERC2P2表达量,对临床胶质瘤病人级别和生存期预测具有指导意义。
附图说明
图1是本发明Taqman探针PCR过程图;
图2是本发明HERC2P2的表达量与胶质瘤级别之间的关系图;
图3是本发明HERC2P2的表达量与病人存活率之间的关系图。
具体实施方式
1.HERC2P2基因的核苷酸序列(GeneID:400322)
tcggcccgcccctcgggccgcgagaggcgccgggatcgcgggcgccggctgagccagcgg60
ctcttgggaggctgcgtccgcgcgccggcggggcgaggcggccgggccctgcgcgtcagg120
cctgagacctgggaggaagctggagaaaagatgccctctgaatctttgtgtttggctgcc180
caggctcgcctcgactccaaatggttgaaaacagatatacagcttgcattcacaagagat240
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