[发明专利]一组用于猪源性实时荧光PCR检测的特异性引物和探针在审
申请号: | 201610127201.7 | 申请日: | 2016-03-07 |
公开(公告)号: | CN105671167A | 公开(公告)日: | 2016-06-15 |
发明(设计)人: | 车团结;沈颂东;尤崇革;谢小冬;李琳;李亚鹏 | 申请(专利权)人: | 苏州百源基因技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京中恒高博知识产权代理有限公司 11249 | 代理人: | 吕玉博 |
地址: | 215000 江苏省苏州市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 用于 猪源性 实时 荧光 pcr 检测 特异性 引物 探针 | ||
1.一组用于猪源性实时荧光PCR检测的特异性引物和探针,其特征在于:所述特异性引 物和探针的核苷酸序列为(1)或(2)中的一种:
(1)、上游引物:5'-ACGATTCTTCGCCTTTCACT-3'
下游引物:5'-GGGGTGTAGTTGTCTGGGTC-3'
探针:5'-ATTACCGCCCTCGCAGCCGTACA-3'
所述引物和探针扩增的目标核苷酸序列为序列表中SEQIDNo.3;
(2)、与(1)所述序列互补的序列。
2.根据权利要求所述的引物和探针,其特征在于:所述探针的5’端荧光报告基团是 FAM,3’端标记的是荧光淬灭基团TAMRA。
3.猪源性的PCR检测试剂盒,所述试剂盒为猪源性的定性或定量检测试剂盒;其特征在 于:所述试剂盒包括权利要求1所述的引物和探针;
作为优选,所述定量检测试剂盒还包括标准品,所述标准品的制备方法为:将猪源性保 守基因片段插入到载体pMD18-T中,转化至大肠杆菌中进行诱导表达,获得含有猪源性保守 基因片段的重组质粒,以此作为标准品;所述猪源性保守基因片段为序列表中SEQID No.2;
作为进一步优选,所述猪源性保守基因片段是以序列表中SEQIDNo.1的核苷酸序列 为模板,使用下述引物进行PCR扩增获得的:
上游引物:5'-TACGGTCATCACAAATCTACTATC-3'
下游引物:5'-ATATTATGCTTCGTTGTTTGG-3';
作为优选,所述PCR扩增的条件为:94℃预变性5min;94℃30s、55℃30s、72℃30s,35 个循环;72℃10min。
4.权利要求1或2所述的特异性引物和探针在制备定性或定量检测猪源性的试剂盒中 的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于:所述应用是分别以标准品和待测样品DNA 为模板,利用特异性引物和探针进行实时荧光定量PCR,通过标准曲线和待测样品的Ct值判 定结果。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:所述实时荧光定量PCR的反应条件为:94℃ 预变性2分钟,94℃15秒、60℃40s并收集荧光信号,40个循环。
7.猪源性的实时荧光定量PCR检测方法,所述检测方法不以有生命的人体或动物体为 直接实施对象,其特征在于:步骤如下:
(1)制备标准品:将猪源性保守基因片段插入到载体pMD18-T中,转化至大肠杆菌中进 行诱导表达,获得含有猪源性保守基因片段的重组质粒,以此作为标准品;所述猪源性保守 基因片段为序列表中SEQIDNo.2;
(2)使用权利要求1所述的特异性引物和探针对待测样品和标准品采用相同的反应体 系进行实时荧光PCR扩增;
(3)标准曲线绘制;
(4)通过标准曲线和待测样品的Ct值进行猪源性的快速定量检测。
8.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于:步骤(1)中所述猪源性保守基因片段 是通过以下引物扩增得到的:
上游引物为5'-TACGGTCATCACAAATCTACTATC-3';
下游引物为5'-ATATTATGCTTCGTTGTTTGG-3';
作为优选,PCR扩增所述猪源性保守基因片段的条件为:94℃预变性5min;94℃30s、55 ℃30s、72℃30s,35个循环;72℃10min;
作为优选,步骤(2)中所述引物和探针的用量均为1.6μl;
作为优选,步骤(2)中所述实时荧光PCR扩增的反应条件为:94℃预变性2分钟,94℃ 15秒、60℃40s并收集荧光信号,40个循环。
9.猪源性的定性PCR检测方法,所述检测方法不以有生命的人体或动物体为直接实施 对象,其特征在于:步骤如下:
(1)使用权利要求1所述的特异性引物和探针对待测样品进行实时荧光PCR扩增;
(2)通过待测样品的Ct值对猪源性进行定性检测:当Ct值小于38时,为阳性;否则,为阴 性;
作为优选,步骤(1)中所述引物和探针的用量均为1.6μl;
作为优选,步骤(1)中所述实时荧光PCR扩增的反应条件为:94℃预变性2分钟,94℃ 15秒、60℃40s并收集荧光信号,40个循环。
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