[发明专利]检测小麦是否含有簇毛麦6VS染色体臂的成套试剂与分子标记有效
申请号: | 201610156871.1 | 申请日: | 2016-03-18 |
公开(公告)号: | CN105586432B | 公开(公告)日: | 2019-02-05 |
发明(设计)人: | 林志珊;刘畅;叶兴国;王轲;杜丽璞;李仕金;陈孝 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;任凤华 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 小麦 是否 含有 簇毛麦 vs 染色体 成套 试剂 分子 标记 | ||
1.检测或辅助检测小麦是否含有簇毛麦6VS染色体臂的成套试剂,由A-P与B-P、C-P、D-P和E-P中的至少一种组成;
所述A-P由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA组成;
所述B-P由序列表中序列3和序列4所示的两条单链DNA组成;
所述C-P由序列表中序列5和序列6所示的两条单链DNA组成;
所述D-P由序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA组成;
所述E-P由序列表中序列9和序列10所示的两条单链DNA组成。
2.检测或辅助检测小麦是否含有簇毛麦6VS染色体臂的引物对,为权利要求1中所述A-P。
3.检测或辅助检测小麦是否含有簇毛麦6VS染色体臂的成套试剂,由权利要求1所述成套试剂或权利要求1中所述A-P与X1组成;所述X1为F-P、G-P和H-P中的至少一种;
所述F-P由序列表中序列11和序列12所示的两条单链DNA组成;
所述G-P由序列表中序列13和序列14所示的两条单链DNA组成;
所述H-P由序列表中序列15和序列16所示的两条单链DNA组成。
4.检测或辅助检测小麦是否含有簇毛麦6VS染色体臂的系统,为系统A1、系统A2或系统A3;
所述系统A1由权利要求1所述成套试剂与进行PCR扩增所需的试剂和/或仪器组成;
所述系统A2由权利要求1中所述A-P与进行PCR扩增所需的试剂和/或仪器组成;
所述系统A3由权利要求3所述成套试剂与进行PCR扩增所需的试剂和/或仪器组成。
5.检测或辅助检测小麦是否含有簇毛麦6VS染色体臂的方法,为下述R或S:
R、下述R1)或R2):
R1)包括R11)和R12):
R11)分别以待测小麦、参比小麦和簇毛麦的基因组DNA为模板,用5种引物对分别进行PCR扩增,得到所述5种引物对的待测小麦PCR产物、所述5种引物对的参比小麦PCR产物和所述5种引物对的簇毛麦PCR产物;所述参比小麦为不含簇毛麦6VS染色体臂的小麦,作为确定簇毛麦特异条带的参比;
R12)将所述5种引物对的待测小麦PCR产物、所述5种引物对的参比小麦PCR产物和所述5种引物对的簇毛麦PCR产物进行电泳,根据电泳结果确定所述5种引物对的待测小麦PCR产物中是否含有簇毛麦相应引物对的特异条带,如果所述5种引物对的待测小麦PCR产物中至少有一种引物对的待测小麦PCR产物中含有簇毛麦相应引物对的特异条带,所述待测小麦含有或候选含有簇毛麦6VS染色体臂;如果所述5种引物对的待测小麦PCR产物中均不含有簇毛麦相应引物对的特异条带,所述待测小麦不含或候选不含簇毛麦6VS染色体臂;
所述5种引物对为权利要求1中所述A-P、所述B-P、所述C-P、所述D-P和所述E-P;
R2)包括R21)和R22):
R21)以待测小麦的基因组DNA为模板,用所述5种引物对分别进行PCR扩增,得到所述5种引物对的待测小麦PCR产物;
R22)检测R21)所述5种引物对的待测小麦PCR产物的序列,如所述5种引物对的待测小麦PCR产物中含A、B、C、D和E中的至少一种,所述待测小麦含有或候选含有簇毛麦6VS染色体臂;如所述5种引物对的待测小麦PCR产物中均不含A、B、C、D和E中的任一种或任几种,所述待测小麦不含或候选不含簇毛麦6VS染色体臂;
S、下述S1)或S2):
S1)包括S11)和S12):
S11)分别以待测小麦、参比小麦和簇毛麦的基因组DNA为模板,用8种引物对分别进行PCR扩增,得到所述8种引物对的待测小麦PCR产物、所述8种引物对的参比小麦PCR产物和所述8种引物对的簇毛麦PCR产物;所述参比小麦为不含簇毛麦6VS染色体臂的小麦,作为确定簇毛麦特异条带的参比;
S12)将所述8种引物对的待测小麦PCR产物、所述8种引物对的参比小麦PCR产物和所述8种引物对的簇毛麦PCR产物进行电泳,根据电泳结果确定所述8种引物对的待测小麦PCR产物中是否含有簇毛麦相应引物对的特异条带,如果所述8种引物对的待测小麦PCR产物中至少有一种引物对的待测小麦PCR产物中含有簇毛麦相应引物对的特异条带,所述待测小麦含有或候选含有簇毛麦6VS染色体臂;如果所述8种引物对的待测小麦PCR产物中均不含有簇毛麦相应引物对的特异条带,所述待测小麦不含或候选不含簇毛麦6VS染色体臂;
所述8种引物对为权利要求1中所述A-P、所述B-P、所述C-P、所述D-P和所述E-P以及权利要求3中所述F-P、所述G-P、所述H-P;
S2)包括S21)和S22):
S21)以待测小麦的基因组DNA为模板,用所述8种引物对分别进行PCR扩增,得到所述8种引物对的待测小麦PCR产物;
S22)检测S21)所述8种引物对的待测小麦PCR产物的序列,如所述8种引物对的待测小麦PCR产物中含有A、B、C、D、E、F、G和H中的至少一种,所述待测小麦含有或候选含有簇毛麦6VS染色体臂;如所述8种引物对的待测小麦PCR产物中均不含A、B、C、D、E、F、G和H中的任一种或任几种,所述待测小麦不含或候选不含簇毛麦6VS染色体臂;
所述A为序列17所示的DNA分子;
所述B为序列18所示的DNA分子;
所述C为序列19所示的DNA分子;
所述D为序列20所示的DNA分子;
所述E为序列21所示的DNA分子;
所述F为序列22所示的DNA分子;
所述G为序列23所示的DNA分子;
所述H为序列24所示的DNA分子;
所述簇毛麦相应引物对的特异条带为同一种引物对的簇毛麦PCR产物含有但所述同一种引物对的所述参比小麦的PCR产物不含有的条带。
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