[发明专利]用于鉴定黄颡鱼和长吻鮠杂交种的引物组、试剂盒和方法在审
申请号: | 201610159878.9 | 申请日: | 2016-03-21 |
公开(公告)号: | CN105695590A | 公开(公告)日: | 2016-06-22 |
发明(设计)人: | 梁宏伟;郭闪闪;罗相忠;李忠;邹桂伟 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院长江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 陈卫 |
地址: | 430223 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 黄颡鱼 长吻鮠 杂交种 引物 试剂盒 方法 | ||
1.用于鉴定黄颡鱼和长吻鮠杂交种的父本和母本的引物组,其特征在于,包括以下引 物:
用于扩增COI基因的引物对,由具有SEQIDNO.1所示序列的引物COIF:5’- CTACAATCCACCGCCTAA-3’以及具有SEQIDNO.2所示序列的引物COIR:5’- TAGAAGAAAGTGACAGAGCG-3’组成;
用于扩增ITS序列的引物对,由具有SEQIDNO.3所示序列的引物ITSF:5’- CGTAACAAGGTTTCCGTAGGTG-3’以及具有SEQIDNO.4所示序列的引物ITSR:5’- ATCCACCGCTAAGAGTTGTCAG-3’组成。
2.用于鉴定黄颡鱼和长吻鮠杂交种的父本和母本的试剂盒,其特征在于,包含权利要 求1所述的引物组。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,还包含以下试剂中的一种或多种:PCR用 的缓冲液、dNTP、耐热的DNA聚合酶、克隆载体、DNA连接酶、连接反应用的缓冲液。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述耐热的DNA聚合酶为TaqDNA聚合 酶、LATaqDNA聚合酶、pfuDNA聚合物或其他用于在PCR反应中合成DNA的DNA聚合酶,或这 些DNA聚合酶的组合。
5.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述DNA连接酶为T4DNA连接酶。
6.根据权利要求2-5所述的试剂盒,其特征在于,所述克隆载体选自pMD18-T、pBR系列 载体、PUC系列载体以及其他用于原核扩增的质粒载体。
7.一种鉴定黄颡鱼和长吻鮠杂交种的父本和母本的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待鉴定个体的DNA、黄颡鱼的DNA和长吻鮠的DNA;
2)以步骤1)中得到待鉴定个体的DNA为模板,使用权利要求1中所述的用于扩增COI基 因的引物对PCR扩增COI基因;
3)将步骤2)得到的扩增产物克隆至克隆载体上,然后用携带有所述扩增产物的克隆载 体转化大肠杆菌感受态细胞,挑取单菌落测序;
4)利用遗传分析软件将步骤3)测序得到的序列与SEQIDNO.5所示的标准黄颡鱼COI 基因序列和SEQIDNO.6所示的标准长吻鮠COI基因序列构建进化树,通过聚类结果判定所 述待测个体的母本,如果步骤3)所得到的序列与SEQIDNO.5聚类到一枝,则母本为黄颡 鱼,如果与SEQIDNO.6聚类到一枝,则母本为长吻鮠;
5)分别以步骤1)中得到待鉴定个体的DNA、黄颡鱼的DNA和长吻鮠的DNA为模板,使用权 利要求1中所述的用于扩增ITS序列的引物PCR对扩增ITS序列;
6)将步骤5)中扩增得到的三种DNA片段进行琼脂糖电泳,如果从所述待鉴定个体扩增 到600bp和700bp长的两条扩增带,则所当步骤4)确定所述待鉴定个体的母本为黄颡鱼时, 所述待鉴定个体的父本为长吻鮠,当步骤4)确定所述待鉴定个体的母本为长吻鮠时,所述 待鉴定个体的父本为黄颡鱼。
8.根据权利要求7所述的鉴定黄颡鱼和长吻鮠杂交种的父本和母本的方法,其特征在 于,步骤4)中用到的所述遗传分析软件为MEGA。
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