[发明专利]一种用双重复合免疫捕获RT-PCR同步检测百合隐症病毒和斑驳病毒的方法有效

专利信息
申请号: 201610210126.0 申请日: 2016-04-07
公开(公告)号: CN105713994B 公开(公告)日: 2020-02-18
发明(设计)人: 张玉宝;王亚军;谢忠奎;王若愚;杨果;郭志鸿;王乐 申请(专利权)人: 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6804;C12R1/94
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 730000 甘肃*** 国省代码: 甘肃;62
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摘要:
搜索关键词: 一种 双重 复合 免疫 捕获 rt pcr 同步 检测 百合 病毒 斑驳 方法
【权利要求书】:

1.一种用双重复合免疫捕获RT-PCR同步检测百合隐症病毒LSV和斑驳病毒LMoV的方法,其特征在于,包括以下步骤:

①引物设计

根据LSV和LMoV的CP基因序列, 设计LSV和LMoV的特异性正向和反向引物,扩增LSV和LMoV目的片段的大小分别为198bp和395bp;其中LSV和LMoV的特异性正向和反向引物序列为:

LSV-F:5’- TATGGGCTTCCAATACAAC-3’

LSV-R:5’-TATTCGGTTTCCAGGTTC-3’

LMoV-F:5’- TGGCACCTCACCAAATGTA -3’

LMoV-R:5’-CATCATCTGCTGTATGCCTCT-3’;

②双重复合免疫捕获

1)取100mg复合感染LSV+LMoV的组织,加1mL PBST研磨后将研磨液转入1.5mL灭菌离心管中,4000rpm离心2min,上清液即感病组织粗提液;

2)用pH9.6的碳酸盐缓冲液将LMoV和LSV多克隆抗体稀释后混合,使LMoV和LSV两种抗体的终浓度分别为1μg/mL和10μg/mL;取200μL上述稀释的混合抗体加入PCR管,37℃孵育2h;

3)弃去步骤2)中两种抗体的包被混合液,用PBST洗3次,每次3min; 加入200μL感病组织粗提液,37℃孵育3h;

4)弃去步骤3)中的感病组织粗提液,用 PBST洗3次,ddH2O洗1次,短暂离心,吸去残液;

③双重RT-PCR

1) 在包被过的PCR管中分别加入10 μmol/L的LSV和LMoV特异性反向引物LSV-R 和LMoV-R 各2μL以及ddH2O 8μL,混合后于70℃保温10min,之后迅速冰浴2 min;

2)双重RT:向上述PCR管中分别加入5×M-MLV buffer 4μL、10mmol/L 的dNTP混合物2μL、30U/μL的RNase抑制剂0.68μL、200U /μL 的M-MLV反转录酶0.70μL以及DEPC-H2O 0.62μL,混合均匀后,42℃水浴1h,70℃保温15 min,得到两种病毒的cDNAs混合物;

3)双重PCR:取一新的PCR管,分别加入上述步骤2)中两种病毒的cDNAs混合物2.0μL、10×PCR buffer 2.5μL、25 mmol/L 的MgCl2 2.5μL、2.5mmol/L 的dNTP混合物2.5μL、10μmol/L 的LSV特异性正向和反向引物LSV-F 和LSV-R各0.5μL、10μmol/L 的LMoV特异性正向和反向引物LMoV-F 和LMoV-R 各0.5μL、5U/μL的TaqDNA聚合酶 0.3μL以及ddH2O 13.2μL,混合均匀后进行双重PCR;上述双重PCR的反应条件为: 94℃预变性4min,94℃变性30s,50℃~58℃退火45s,72℃延伸1min,扩增30~35个循环,72℃延伸7min,降至常温;

④电泳检测

上述步骤③中双重PCR反应结束后取10μL反应产物进行2.0%琼脂糖凝胶电泳,在1×TBE缓冲液环境中,100V稳压电泳40min,然后用凝胶成像系统观察并记录结果,LSV和LMoV两种病毒核酸片段的电泳条带分别出现在198bp和395bp处;

⑤结果分析

根据电泳胶上扩增条带的有无及其大小判定所检测的样品是否感染LSV或LMoV,若凝胶中仅存在198bp的核酸片段则说明样品中含有LSV;若凝胶中仅存在395bp的核酸片段则说明样品中含有LMoV;若凝胶中同时存在198bp和395bp的核酸片段,则说明样品中同时含有LSV和LMoV。

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