[发明专利]利用线粒体分子标记鉴定牧草盲蝽种群的方法在审
申请号: | 201610212419.2 | 申请日: | 2016-04-07 |
公开(公告)号: | CN105713979A | 公开(公告)日: | 2016-06-29 |
发明(设计)人: | 张利娟;崔金杰;雒珺瑜;张帅;王春义;吕丽敏;朱香镇;王丽;李春花 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院棉花研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 455004 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 线粒体 分子 标记 鉴定 牧草 种群 方法 | ||
1.用于鉴定牧草盲蝽种群的PCR引物组合,其特征在于,所述引物组合包括引物对①~④中的至少两种:①PCR扩增牧草盲蝽线粒体细胞色素氧化酶II基因的引物对,②扩增细胞色素b基因的引物对,③扩增线粒体NADH脱氢酶亚基5基因的引物对;④扩增16SrDNA的引物对;引物序列如下:
①L-COII-F:5'–TGGCAGAATAAGTGCCATGA–3'
L-COII-R:5'–GAGACCAATGCTTTCTTTCAGC–3'
②L-ND5-F:5'–AAACATAATTACCTGAACCCATGAA–3'
L-ND5-R:5'–TCTTCAACTTTAGTAACTGCAGGAG–3'
③L-Cytb-F:5'–TCTAATTGATCTTCCTAGCCCAAG–3'
L-Cytb-R:5'–CCGTGCTCCAATTCATGTTA–3'
④L-16S-F:5'–TCCACAAATATCCCCAATCTG–3'
L-16S-R:5'–CCTTGAAATGTCCCTTCTCG–3'。
2.根据权利要求1所述的PCR引物组合,其特征在于,所述引物组合包括引物对①~④。
3.含有权利要求1或2所述引物组合的用于鉴定牧草盲蝽种群的PCR检测试剂盒。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTPs、TaqDNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液、标准阳性模板中的至少一种。
5.利用线粒体分子标记鉴定牧草盲蝽种群的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测牧草盲蝽的基因组DNA;
2)以步骤1)中提取的DNA为模板,利用权利要求1或2所述引物对①~④分别进行PCR扩增反应;
3)纯化并分析PCR产物。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,PCR反应体系为:5×PCR反应缓冲液5μL,10mMdNTPs0.5μL,5U/μlTaqDNA聚合酶0.5μL,10μM上、下游引物各1μL,模板DNA2μL,无菌水补足至25μL。
7.根据权利要求5或6所述的方法,其特征在于,PCR扩增程序为:94℃预变性3min;94℃变性1min,55℃退火1min,72℃延伸1min,30个循环;72℃延伸5min,4℃保存。
8.根据权利要求5-7任一项所述的方法,其特征在于,步骤3)中分别对PCR产物进行纯化和测序后,将测序结果按照COII-ND5-Cytb-16SrDNA串联拼接,串联序列大小为3190bp,新疆种群第300、543、1204、1279、1981、2509、2999、3161bp处碱基依次为A、A、T、G、A、A、A、C,甘肃宁夏种群依次为G、G、C、A、G、G、G、T。
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