[发明专利]TCRβ链互补决定区的处理方法在审

专利信息
申请号: 201610317368.X 申请日: 2016-05-12
公开(公告)号: CN107345242A 公开(公告)日: 2017-11-14
发明(设计)人: 眭维国;戴勇 申请(专利权)人: 眭维国;戴勇
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司44224 代理人: 何平
地址: 541000 广西壮族*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: tcr 互补 决定 处理 方法
【权利要求书】:

1.一种TCRβ链互补决定区的处理方法,其特征在于,包括以下步骤:

设置实验组与对照组,每组包括若干份相异人体的已经脱离人体的外周血标本;

分离各所述外周血标本的淋巴细胞,并分别提取所述外周血标本淋巴细胞中的DNA;

采用多重PCR技术,构建DNA文库;

对所述DNA文库进行高通量测序,对所述实验组及对照组中的TCRβ链互补决定区进行数据分析。

2.根据权利要求1所述的处理方法,其特征在于,采用多重PCR技术之前,所述处理方法还包括测定DNA的含量以及检测DNA完整性的步骤。

3.根据权利要求2所述的处理方法,其特征在于,采用荧光分析法测定DNA的含量。

4.根据权利要求2所述的处理方法,其特征在于,用琼脂糖凝胶电泳法检测DNA完整性。

5.根据权利要求1所述的处理方法,其特征在于,利用Illumina MiSeq平台对DNA文库进行高通量测序。

6.根据权利要求1所述的处理方法,其特征在于,采用多重PCR技术,构建DNA文库,其具体包括:

计算所述实验组及对照组中DNA的取用量,称取,并加入V区引物及J区引物进行多重PCR;

电泳检测回收多重PCR产物;

加入末端修护混合液进行末端修护反应,并纯化;

将纯化后的产物在3’端连上A碱基;

在接头连接反应体系中进行接头连接;

通过PCR反应富集经过接头修饰的DNA片段,并对PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,切取目的片段后,纯化回收,得到DNA文库。

7.根据权利要求6所述的处理方法,其特征在于,构建DNA文库后,还 包括检测所述DNA文库的插入片段范围及对所述DNA文库的浓度进行定量。

8.根据权利要求1所述的处理方法,其特征在于,对所述实验组及对照组中的TCRβ链互补决定区进行数据分析包括:对测序数据进行质控和预处理、对数据进行比对分析、对序列结构进行分析、构建免疫组库及对免疫组库进行差异分析。

9.根据权利要求8所述的处理方法,其特征在于,对测序数据进行质控和预处理包括:对测序后的数据进行过滤处理。

10.根据权利要求1所述的处理方法,其特征在于,采用Ficoll密度梯度离心法分离出所述外周血标本的淋巴细胞。

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