[发明专利]胃癌环状RNA的处理方法

权利要求书

1.一种胃癌环状RNA的处理方法，其特征在于，包括以下步骤：

获取已经脱离人体的胃癌组织和正常癌旁组织，并冷冻；

分别提取所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA；

分别筛选出所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA中的circRNA及mRNA，并分别与表达芯片杂交；

分别筛选出所述胃癌组织及正常癌旁组织差异表达的circRNA及mRNA，并对所述胃癌组织及正常癌旁组织显著差异的circRNA与mRNA进行整合分析。

2.根据权利要求1所述的处理方法，其特征在于，在筛选出所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA中的circRNA及mRNA步骤之前，还包括：检测所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA的浓度及纯度，以及检测所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA的完整性。

3.根据权利要求2所述的处理方法，其特征在于，使用NanoDrop ND-1000分光光度计检测所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA的浓度及纯度。

4.根据权利要求2所述的处理方法，其特征在于，使用变性琼脂糖凝胶电泳法检测所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA的完整性。

5.根据权利要求1所述的处理方法，其特征在于，利用TRIzol试剂提取所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA。

6.根据权利要求1所述的处理方法，其特征在于，筛选出所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA中的circRNA，包括如下步骤：

利用核糖核酸酶R分别消化所述胃癌组织及正常癌旁组织的总RNA，去除所述总RNA中的线性RNA并富集circRNA；

对富集后的circRNA进行扩增，并利用随机引物法将扩增后的circRNA转录成荧光cRNA探针；

利用试剂盒纯化荧光cRNA探针；

利用NanoDrop ND-1000分光光度计检测荧光cRNA探针的浓度和活性。

7.根据权利要求1所述的处理方法，其特征在于，筛选出所述胃癌组织及 正常癌旁组织差异表达的circRNA，包括如下步骤：

分别扫描与circRNA杂交后的表达芯片，并将扫描图片导入Agilent FeatureExtraction软件并读值，得到原始数据；

采用R软件包对所述原始数据进行归一化及后续分析；

利用Fold Change和P-value筛选出所述胃癌组织及正常癌旁组织差异表达的circRNA。

8.根据权利要求1所述的处理方法，其特征在于，所述胃癌组织及正常癌旁组织的circRNA的差异表达基因包括：hsa_circRNA_400071、hsa_circRNA_000792、hsa_circRNA_000543、hsa_circRNA_001959、hsa_circRNA_400066及hsa_circRNA_001066。

9.根据权利要求1所述的处理方法，其特征在于，所述胃癌组织及正常癌旁组织的mRNA的差异表达基因包括：MYH9、CD44、MALAT1、CXXC5、ARVCF及ARIH1。

10.根据权利要求1所述的处理方法，其特征在于，还包括采用RT-PCR验证差异表达的circRNA及mRNA。