[发明专利]适用于H7N9禽流感病毒实时荧光定量PCR检测的质粒标准物质在审
申请号: | 201610522919.6 | 申请日: | 2016-07-05 |
公开(公告)号: | CN107586776A | 公开(公告)日: | 2018-01-16 |
发明(设计)人: | 许丽;刘刚;梁文;李妍;李兰英;闻艳丽 | 申请(专利权)人: | 上海市计量测试技术研究院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/44;C12Q1/70;C12Q1/6851;G01N27/64;G01N21/33;C12R1/93 |
代理公司: | 上海弼兴律师事务所31283 | 代理人: | 薛琦,沈利 |
地址: | 201203 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 适用于 h7n9 禽流感 病毒 实时 荧光 定量 pcr 检测 质粒 标准 物质 | ||
技术领域
本发明涉及一种生物工程技术领域的质粒分子,具体涉及一种适用于H7N9禽流感病毒实时荧光定量PCR检测的质粒DNA标准物质及其构建方法、定量方法和应用。
背景技术
H7N9禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)首先于2013年3月在我国上海、安徽发现3例,经国家卫生和计划生育委员会确认通报为全球首次发现的感染人的新型禽流感病毒株。随后在我国上海、安徽、江苏、浙江、北京、河南、山东、江西、福建和台湾等地区均出现散发的确诊病例。H7N9病毒感染者常出现严重的肺炎和急性呼吸窘迫综合症(ARDS),甚至多器官功能障碍,病死率高。目前确诊的人数已经达到200多例,其中死亡超过60人。以现有病例数和死亡数字计算,H7N9的病死率达到20%至30%。人感染H7N9禽流感病例的出现受到了世界许多国家以及世界卫生组织(WHO)的关注。因此,H7N9禽流感病毒检测方法及抗病毒药物的研究是当前各国科学家和医药工作者研究的一个关注的重点。
当前针对H7N9禽流感等动物传染病的诊断方法主要有病原学方法、血清学方法和分子生物学方法。病原学诊断方法准确但诊断时间较长,达不到快速检测的需求,同时要求被检测样品有较好的新鲜度;血清学诊断方法的特异性和准确度存在一定的局限性;实时荧光反转录PCR方法(real-time reverse-transcription PCR,real-time RT-PCR)是分子生物学检测方法之一,直接检测病原体RNA,具有快速、特异性强且不受样品新鲜度限制的优点,且较常规PCR灵敏度更高、少污染、操作更便捷、反应更快速,可以为疾病早诊断、早治疗、降低病死率以及控制疫情争取时间,因此已经成为H7N9禽流感病毒检测的重要方法。目前已有较多文献报道使用实时荧光RT-PCR方法检测H7N9病毒,也有相应的试剂盒研制成功并投放市场。
然而在实际的实时荧光RT-PCR方法检测过程中,RNA抽提失败、反转录效率低、PCR体系中存在抑制剂等因素容易造成假阴性结果,因此有必要研究具有明确量值溯源性的标准物质,形成完善的参考系统,开展试验室间质评,提高检测水平。目前针对H7N9禽流感病毒实时荧光RT-PCR检测方法,仍然没有有证标准物质(Certified Reference Material,CRM),各检测单位在检测时常采用病毒阳性样本、提取的病毒RNA、非感染性体外转录RNA、自行研制的质粒DNA分子或试剂盒自带的阳性标准品作为质控品,稳定性差、存在安全隐患、阳性样品难以获取且缺乏统一的定值方法,造成各实验室之间的检测结果差异大,缺乏可比性、有效性和可靠性。
目前针对H7N9禽流感病毒,WHO采用由英国国家生物标准与检定所(National Institute for Biological Standards and Control,NIBSC)研制的一种重组禽流感毒株标准品。这类标准品接近于禽流感病毒,但是存在溯源性限制,价格昂贵,数量较少,并且由于其是病毒,稳定性差,存在一定风险,对运输条件要求较高,较难运输。因此这类标准品不能完全满足各国禽流感病毒临床检验实验室质量控制的需求,也不能满足H7N9检测试剂方法标准化、性能评价的需求,急需研制新型H7N9禽流感病毒检测标准物质。
质粒DNA标准物质是一种含有检测目的基因的特异性片段的重组质粒分子,在PCR定性检测中可以作为阳性对照,在PCR定量分析中可以作为定量分析的标准品,构建定量分析的标准曲线。质粒DNA标准物质的优点主要是可以通过微生物进行大量培养,DNA易于扩增,所以可提供无限量稳定的标准物质,并且纯度较高;且操作容易,稳定性高,同一个质粒分子可以同时包含多个外源目的基因,经济又高效。但是目前质粒DNA标准物质尤其是有证标准物质还是很少,这也是全世界生物计量领域研究的热点,如美国的国家标准技术研究院(NIST)、英国政府化学家实验室(LGC)和欧盟委员会联合研究中心标准物质与测量研究院(IRMM)等研究机构都投入了很大科研力量进行相关标准物质的研发,成果主要集中于转基因检测领域质粒DNA分子标准物质,但是针对病毒检测用的质粒DNA标准物质还是空白。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是为了克服现有的重组禽流感毒株标准品价格昂贵、数量少、不能满足禽流感病毒临床检验实验室质量控制的需求,也不能满足H7N9检测试剂方法标准化、性能评价的需求的问题,提供了一种适用于H7N9禽流感病毒实时荧光定量PCR检测的质粒标准物质及其构建方法、定量方法和应用。
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