[发明专利]一种用于快速检测华法林个体化用药相关基因CYP2C9和VKORC1多态性的试剂盒在审

专利信息
申请号: 201610595563.9 申请日: 2016-07-26
公开(公告)号: CN107653307A 公开(公告)日: 2018-02-02
发明(设计)人: 管俊杰;何胜祥;刘代新 申请(专利权)人: 上海同科生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883
代理公司: 上海精晟知识产权代理有限公司31253 代理人: 冯子玲
地址: 200092 上海市杨*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 快速 检测 华法林 个体化 用药 相关 基因 cyp2c9 vkorc1 多态性 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种检测华法林个体化用药相关基因CYP2C9和VKORC1多态性的试剂盒,其特征在于:包括检测基因CYP2C9*3(1061A/C)和VKORC1(-1639G/A)遗传多态性的引物及探针。

2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:

其中,所述试剂盒包括检测基因CYP2C9(1061A/C)的一个正向引物、一个反向引物及两个检测探针的检测引物探针组合1;检测基因VKORC1(-1639G/A)的一个正向引物、一个反向引物及两个检测探针的检测引物探针组合2;以及检测内参基因的一个正向引物、一个反向引物及一个内控探针的内控引物探针组合。

3.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:

其中,所述CYP2C9(1061A/C)基因多态性的检测引物探针组合1,包括:

正向引物:CYP2C9F:5’-CCCTGCATGCAAGACAGGAG-3’

反向引物:CYP2C9R:5’-ACTTACCTTGGGAATGAGATAG-3’

检测探针:probe1:5’-FAM-TCCAGAGATACATTGACCTTCTCCCC-BHQ2-3’

检测探针:probe2:5’-FAM-TCCAGAGATACCTTGACCTTCTCCCC-BHQ2-3’。

4.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:

其中,所述VKORC1(-1639G/A)基因多态性的检测引物探针组合2,包括:

正向引物:VKORC1F:5’-GTAAGGGATCCCTCTGGGAAG-3’

反向引物:VKORC1R:5’-CACCATGTTGGCCAGGCTTG-3’

检测探针:probe3:5’-CY5-CCACCGCCACCCGGCCAATGGTT-BHQ2-3’

检测探针:probe4:5’-CY5-CCACCGCCACCTGGCCAATGGTT-BHQ2-3’。

5.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:

所述内控引物探针组合,包括:

正向引物:Cont F:5’-CATTCTAAACTGTACCCTGTTACT-3’

反向引物:Cont R:5’-GCCACACTGAGTGAGCTGCACTG-3’

检测探针:probe5:5’-ROX-CCTTCCTATGACATGAACTTAACC-BHQ2-3’。

6.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:

其中,使用引物进行PCR扩增的条件为:温度为95℃,时间为3分钟;再次依照以下程序运行40个循环,变性:温度为95℃,时间为15秒,退火:温度为60℃,时间为20秒,延伸:温度为72℃,时间为30秒。

7.一种利用如权利要求1-6中任意一项所述的检测华法林个体化用药相关基因CYP2C9和VKORC1多态性的试剂盒进行CYP2C9和VKORC1多态性检测的方法,包括步骤:

(1)待测样本处理和模板提取

抽取待检测者的血液样本,保存于抗凝采集管中;从血液样本中获取DNA;测定DNA的浓度和纯度,要求浓度不小于50ng/μl;OD260nm/OD280nm在1.7~2.0之间;

(2)荧光PCR扩增

将待检测模板DNA加入含有本发明所述CYP2C9和VKORC1多态性特异检测引物探针组合及内控引物探针的多色荧光PCR反应液内,在荧光PCR管内混合均匀离心后,放入荧光定量PCR仪器进行PCR反应;

(3)结果分析

在上述PCR反应体系与温度循环程序条件下,判断实验结果的特异性PCR反应体系内目的检测荧光信号是否形成对数扩增“S”型曲线,如果对应的目的检测荧光信号呈对数扩增“S”型曲线则该待检测DNA样本判定为该信号所对应的基因表型为阳性。

8.如权利要求7所述的检测方法,其特征在于:

其中,荧光PCR扩增步骤中采用以下温度循环及信号采集程序进行PCR反应:

温度为95℃,时间为3分钟;再次依照以下程序运行40个循环, 变性:温度为95℃,时间为15秒,退火:温度为60℃,时间为20秒,延伸:温度为72℃,时间为30秒。

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