[发明专利]一种用于快速检测华法林个体化用药相关基因CYP2C9和VKORC1多态性的试剂盒在审
申请号: | 201610595563.9 | 申请日: | 2016-07-26 |
公开(公告)号: | CN107653307A | 公开(公告)日: | 2018-02-02 |
发明(设计)人: | 管俊杰;何胜祥;刘代新 | 申请(专利权)人: | 上海同科生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司31253 | 代理人: | 冯子玲 |
地址: | 200092 上海市杨*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 快速 检测 华法林 个体化 用药 相关 基因 cyp2c9 vkorc1 多态性 试剂盒 | ||
1.一种检测华法林个体化用药相关基因CYP2C9和VKORC1多态性的试剂盒,其特征在于:包括检测基因CYP2C9*3(1061A/C)和VKORC1(-1639G/A)遗传多态性的引物及探针。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
其中,所述试剂盒包括检测基因CYP2C9(1061A/C)的一个正向引物、一个反向引物及两个检测探针的检测引物探针组合1;检测基因VKORC1(-1639G/A)的一个正向引物、一个反向引物及两个检测探针的检测引物探针组合2;以及检测内参基因的一个正向引物、一个反向引物及一个内控探针的内控引物探针组合。
3.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:
其中,所述CYP2C9(1061A/C)基因多态性的检测引物探针组合1,包括:
正向引物:CYP2C9F:5’-CCCTGCATGCAAGACAGGAG-3’
反向引物:CYP2C9R:5’-ACTTACCTTGGGAATGAGATAG-3’
检测探针:probe1:5’-FAM-TCCAGAGATACATTGACCTTCTCCCC-BHQ2-3’
检测探针:probe2:5’-FAM-TCCAGAGATACCTTGACCTTCTCCCC-BHQ2-3’。
4.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:
其中,所述VKORC1(-1639G/A)基因多态性的检测引物探针组合2,包括:
正向引物:VKORC1F:5’-GTAAGGGATCCCTCTGGGAAG-3’
反向引物:VKORC1R:5’-CACCATGTTGGCCAGGCTTG-3’
检测探针:probe3:5’-CY5-CCACCGCCACCCGGCCAATGGTT-BHQ2-3’
检测探针:probe4:5’-CY5-CCACCGCCACCTGGCCAATGGTT-BHQ2-3’。
5.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:
所述内控引物探针组合,包括:
正向引物:Cont F:5’-CATTCTAAACTGTACCCTGTTACT-3’
反向引物:Cont R:5’-GCCACACTGAGTGAGCTGCACTG-3’
检测探针:probe5:5’-ROX-CCTTCCTATGACATGAACTTAACC-BHQ2-3’。
6.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:
其中,使用引物进行PCR扩增的条件为:温度为95℃,时间为3分钟;再次依照以下程序运行40个循环,变性:温度为95℃,时间为15秒,退火:温度为60℃,时间为20秒,延伸:温度为72℃,时间为30秒。
7.一种利用如权利要求1-6中任意一项所述的检测华法林个体化用药相关基因CYP2C9和VKORC1多态性的试剂盒进行CYP2C9和VKORC1多态性检测的方法,包括步骤:
(1)待测样本处理和模板提取
抽取待检测者的血液样本,保存于抗凝采集管中;从血液样本中获取DNA;测定DNA的浓度和纯度,要求浓度不小于50ng/μl;OD260nm/OD280nm在1.7~2.0之间;
(2)荧光PCR扩增
将待检测模板DNA加入含有本发明所述CYP2C9和VKORC1多态性特异检测引物探针组合及内控引物探针的多色荧光PCR反应液内,在荧光PCR管内混合均匀离心后,放入荧光定量PCR仪器进行PCR反应;
(3)结果分析
在上述PCR反应体系与温度循环程序条件下,判断实验结果的特异性PCR反应体系内目的检测荧光信号是否形成对数扩增“S”型曲线,如果对应的目的检测荧光信号呈对数扩增“S”型曲线则该待检测DNA样本判定为该信号所对应的基因表型为阳性。
8.如权利要求7所述的检测方法,其特征在于:
其中,荧光PCR扩增步骤中采用以下温度循环及信号采集程序进行PCR反应:
温度为95℃,时间为3分钟;再次依照以下程序运行40个循环, 变性:温度为95℃,时间为15秒,退火:温度为60℃,时间为20秒,延伸:温度为72℃,时间为30秒。
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