[发明专利]乙肝共价闭合环状DNA磁性捕获技术有效
申请号: | 201610644370.8 | 申请日: | 2016-08-08 |
公开(公告)号: | CN107699562B | 公开(公告)日: | 2021-07-09 |
发明(设计)人: | 郭永灿;涂植光;赵朝辉;王友强 | 申请(专利权)人: | 西南医科大学附属中医医院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/10;B82Y5/00 |
代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李高峡;张娟 |
地址: | 646000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乙肝 共价 闭合 环状 dna 磁性 捕获 技术 | ||
1. 一种制备HBV cccDNA特异性DNA分子探针磁性纳米微球的方法,其特征在于:步骤如下:
(1)采用化学共沉淀法制备Fe3O4纳米粒子;
(2)采用反相乳液法制备硅壳磁性纳米颗粒;
(3)对硅壳磁性纳米颗粒进行亲和素修饰;
(4)偶联针对cccDNA特异序列的ssDNA探针;
所述步骤(2)的方法如下:将Triton X-100、正己醇和环己烷按体积比1:1:4混合均匀,加入Fe3O4纳米粒子溶液,搅拌均匀,然后加入正硅酸乙酯和氨水,持续搅拌24h,反应结束后,用丙酮破坏乳化,收集颗粒,得硅壳磁性纳米颗粒。
2. 根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(1)的方法如下:将1.0mol/L FeCl3溶液与2.0mol/L FeCl2溶液混合,FeCl3溶液与FeCl2溶液的体积比为4:1,加入FeCl2溶液25倍体积的浓度为0.7mol/L的氨水溶液,离心,得黑褐色沉淀,用FeCl2溶液15倍体积的 浓度为2.0mol/L的高氯酸溶液分散,水洗至中性,干燥,得Fe 3O4纳米粒子。
3. 根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:加入Fe3O4纳米粒子溶液的浓度为5mmol/L,加入的量为Triton X-100、正己醇和环己烷混合溶液体积的2/5;正硅酸乙酯和氨水的加入量分别为Triton X-100、正己醇和环己烷混合溶液体积的20倍。
4. 根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(3)的方法如下:将2.5mg/ml 的链霉亲和素溶液加入到硅壳磁性纳米颗粒中,在4℃下恒温振荡培育24h,用PBS缓冲液洗涤颗粒3次,再加入2%的戊二醛溶液在室温下浸泡,得磁性纳米悬浊液。
5.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(4)的方法如下:
1)纳米预处理:取磁性纳米颗粒混悬液,离心,弃上清,加入结合缓冲液,制成浓度为1μg/μl的磁性微粒悬液,其中,结合缓冲液是Tris-HCl和NaCl的混合溶液,Tris-HCl的浓度为20mmol/L,NaCl的浓度为150mmol/L;
2)探针预处理:将探针配制成浓度为10μM的探针溶液;
3)偶联:在步骤1)制得到的磁性微粒悬液中加入15μl步骤2)制得的探针溶液,在37℃、150rpm/min条件下反应2h;
4)封闭、清洗,即可。
6. 根据权利要求5所述的制备方法,其特征在于:所述步骤2)中的探针溶液包含4条探针,4条探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1~4所示,4条探针的5’端均标记有生物素。
7. 权利要求1~6任意一项所述方法制备得到的HBV cccDNA特异性DNA分子探针磁性纳 米微球。
8. 一种富集分离HBV cccDNA的方法,其特征在于:步骤如下:取待检样品,加入权利要求7所述HBV cccDNA特异性DNA分子探针磁性纳米微球,混匀,在外磁场环境中作用20min,去除上清液,通过分子变性解离,即可得到富集分离的cccDNA。
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