[发明专利]一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗鉴定的方法有效
申请号: | 201610740314.4 | 申请日: | 2016-08-26 |
公开(公告)号: | CN106399475B | 公开(公告)日: | 2019-06-04 |
发明(设计)人: | 姚辉;马双姣;陈士林;宋经元;杨兵勋;杨培;周红 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院药用植物研究所;浙江天皇药业有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6806;C12N15/10 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 崔自京 |
地址: | 100193 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 铁皮枫斗 标准序列 药材 序列相似性 分子鉴定 两对引物 铁皮石斛 有效解决 种子种苗 重叠区域 原植物 比对 测序 扩增 分段 | ||
1.一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)样品的DNA提取;
2)应用两对引物对ITS2序列分段进行PCR扩增;
用于分段扩增ITS2序列的引物为:
正向DO-2F:5’-GCATGGTGGCTCCTCGTG-3’;
反向DO-2R:5’-ATGGATTGGGATCACCTAAAA-3’;
正向DO-3F:5’-AAAGGCCTATGCTATTGTGA-3’;
反向DO-3R:5’-CGCTTATTGATATGCTTAAACTC-3’;
3)对分段扩增结果测序后,按重叠区域连接在一起,获得ITS2序列;
4)与SEQ ID No.1所示序列比对分析进行鉴定。
2.根据权利要求1所述的一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,所述样品为铁皮枫斗。
3.根据权利要求1所述的一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,由于铁皮枫斗药材基因组DNA降解严重,提取的DNA浓度很低,需加大模板DNA的体积;PCR扩增体系25μL,包括2×TaqPCR Mix12.5μL,2.5μmol·L-1的特异引物正反向各1.0μL,DNA模板溶液10.5μL。
4.根据权利要求1或权利要求2所述的一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,所述的PCR扩增条件为:
引物DO-2F/DO-2R进行PCR扩增反应参数:95℃5min;94℃30s,54℃30s,72℃45s,40个循环;72℃10min;
引物DO-3F/DO-3R进行PCR扩增反应参数:95℃5min;94℃30s,52℃30s,72℃45s,40个循环;72℃10min。
5.根据权利要求1或权利要求2所述的一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,用DNAMAN软件对样品的ITS2序列与SEQ ID No.1所示序列进行比对,序列相似性大于或等于99%,则鉴定为铁皮枫斗。
6.权利要求1-5任一项所述一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法在鉴别铁皮枫斗及其基原植物、种子、种苗中的应用。
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