[发明专利]一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗鉴定的方法有效

专利信息
申请号: 201610740314.4 申请日: 2016-08-26
公开(公告)号: CN106399475B 公开(公告)日: 2019-06-04
发明(设计)人: 姚辉;马双姣;陈士林;宋经元;杨兵勋;杨培;周红 申请(专利权)人: 中国医学科学院药用植物研究所;浙江天皇药业有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6806;C12N15/10
代理公司: 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 代理人: 崔自京
地址: 100193 北京*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 铁皮枫斗 标准序列 药材 序列相似性 分子鉴定 两对引物 铁皮石斛 有效解决 种子种苗 重叠区域 原植物 比对 测序 扩增 分段
【权利要求书】:

1.一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)样品的DNA提取;

2)应用两对引物对ITS2序列分段进行PCR扩增;

用于分段扩增ITS2序列的引物为:

正向DO-2F:5’-GCATGGTGGCTCCTCGTG-3’;

反向DO-2R:5’-ATGGATTGGGATCACCTAAAA-3’;

正向DO-3F:5’-AAAGGCCTATGCTATTGTGA-3’;

反向DO-3R:5’-CGCTTATTGATATGCTTAAACTC-3’;

3)对分段扩增结果测序后,按重叠区域连接在一起,获得ITS2序列;

4)与SEQ ID No.1所示序列比对分析进行鉴定。

2.根据权利要求1所述的一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,所述样品为铁皮枫斗。

3.根据权利要求1所述的一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,由于铁皮枫斗药材基因组DNA降解严重,提取的DNA浓度很低,需加大模板DNA的体积;PCR扩增体系25μL,包括2×TaqPCR Mix12.5μL,2.5μmol·L-1的特异引物正反向各1.0μL,DNA模板溶液10.5μL。

4.根据权利要求1或权利要求2所述的一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,所述的PCR扩增条件为:

引物DO-2F/DO-2R进行PCR扩增反应参数:95℃5min;94℃30s,54℃30s,72℃45s,40个循环;72℃10min;

引物DO-3F/DO-3R进行PCR扩增反应参数:95℃5min;94℃30s,52℃30s,72℃45s,40个循环;72℃10min。

5.根据权利要求1或权利要求2所述的一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,其特征在于,用DNAMAN软件对样品的ITS2序列与SEQ ID No.1所示序列进行比对,序列相似性大于或等于99%,则鉴定为铁皮枫斗。

6.权利要求1-5任一项所述一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法在鉴别铁皮枫斗及其基原植物、种子、种苗中的应用。

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