[发明专利]一种鉴定小麦籽粒性状的特异SNP及其应用有效
申请号: | 201610752814.X | 申请日: | 2016-08-29 |
公开(公告)号: | CN107794307B | 公开(公告)日: | 2020-05-12 |
发明(设计)人: | 刘红霞;阿韦斯拉希德;马琳;张学勇 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;何叶喧 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 小麦 籽粒 性状 特异 snp 及其 应用 | ||
1.一种鉴别或辅助鉴别小麦籽粒性状的方法,包括如下步骤:
检测待测小麦的基因组DNA中基于488SNP位点的基因型为AA基因型、AC基因型还是CC基因型;AA基因型小麦的籽粒性状优于CC基因型小麦;
所述籽粒性状优体现为千粒重高和/或粒长长;
所述488SNP位点为序列表的序列8自5’末端第22位核苷酸。
2.一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重的方法,包括如下步骤:
检测待测小麦的基因组DNA中基于488SNP位点的基因型为AA基因型、AC基因型还是CC基因型;如果为AA基因型、待测小麦候选为高千粒重小麦;如果为CC基因型、待测小麦候选为低千粒重小麦;
所述高千粒重小麦为籽粒千粒重≥35g的小麦;所述低千粒重小麦为籽粒千粒重<35g的小麦;
所述488SNP位点为序列表的序列8自5’末端第22位核苷酸。
3.一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长的方法,包括如下步骤:
检测待测小麦的基因组DNA中基于488SNP位点的基因型为AA基因型、AC基因型还是CC基因型;如果为AA基因型、待测小麦候选为长粒长小麦;如果为CC基因型、待测小麦候选为短粒长小麦;
所述长粒长小麦为籽粒粒长≥0.65mm的小麦;所述短粒长小麦为籽粒粒长<0.65mm的小麦;
所述488SNP位点为序列表的序列8自5’末端第22位核苷酸。
4.用于检测小麦的基因组DNA中基于488SNP位点的基因型的物质的应用,为如下(d2)或(d3)或(d4):
(d2)鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重;
(d3)鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长;
(d4)制备具有(d2)或(d3)所述用途的试剂盒;
所述488SNP位点为序列表的序列8自5’末端第22位核苷酸。
5.特异DNA分子,如序列表的序列8所示。
6.引物组Ⅰ,由488F1、488F2和488C组成;
所述488F1为序列表的序列5所示的单链DNA分子;
所述488F2为序列表的序列6所示的单链DNA分子;
所述488C为序列表的序列7所示的单链DNA分子。
7.引物组Ⅱ,由TaTPP-F1和TaTPP-R1组成;
所述TaTPP-F1为序列表的序列1所示的单链DNA分子;
所述TaTPP-R1为序列表的序列2所示的单链DNA分子。
8.权利要求6或7所述引物组的应用,为如下(d2)或(d3)或(d4):
(d2)鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重;
(d3)鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长;
(d4)制备具有(d2)或(d3)所述用途的试剂盒。
9.一种试剂盒,含有权利要求6或7所述引物组;所述试剂盒的用途为如下(d2)或(d3):
(d2)鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重;
(d3)鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长。
10.权利要求1至3中任一所述方法或权利要求5所述特异DNA分子或权利要求6或7所述引物组或权利要求9所述试剂盒在小麦育种中的应用。
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