[发明专利]一种肿瘤基因检测流水线的模块化系统及方法在审

专利信息
申请号: 201610754639.8 申请日: 2016-08-29
公开(公告)号: CN107794216A 公开(公告)日: 2018-03-13
发明(设计)人: 施琳;王溦清 申请(专利权)人: 埃提斯生物技术(上海)有限公司
主分类号: C12M1/34 分类号: C12M1/34;C12Q1/6869
代理公司: 北京慧智兴达知识产权代理有限公司11615 代理人: 韩龙
地址: 201114 上海市闵*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 肿瘤 基因 检测 流水线 模块化 系统 方法
【权利要求书】:

1.一种肿瘤基因检测流水线的模块化系统,其特征在于,该系统由能够扩充的由白细胞和血浆分离模块、病理检查模块、DNA抽提模块、DNA片段化模块、文库构建模块、捕获DNA模块、以及上机测序模块构成的模块集中部分或全部模块排列组合而成,其中,模块的选用和排列组合方式与检测样本的类型有关,构成肿瘤基因检测流水线的模块化系统的各个模块内条件和状态的配置与检测样本的类型有关。

2.如权利要求1所述的肿瘤基因检测流水线的模块化系统,其特征在于,模块的选用和排列组合方式与检测任务的类型有关。

3.如权利要求1所述的肿瘤基因检测流水线的模块化系统,其特征在于,每个模块包括如下七个子模块中部分或全部子模块:待生产、生产中、待审核、待移交、异常处理、取消生产以及省略子模块。

4.如权利要求3所述的肿瘤基因检测流水线的模块化系统,其特征在于,样本能够在开始生产前通过“待生产”子模块中的“退回”按钮从本模块返回至上一模块,生产完成且审核合格的样本通过“待移交”子模块中的“移交”按钮进入下一模块,审核不合格则进入“异常处理”子模块的样本根据剩余样本情况返回至“待生产”子模块重新生产,直至无剩余样本时“取消生产”。

5.如权利要求3所述的肿瘤基因检测流水线的模块化系统,其特征在于,通过“省略”子模块中的“省略”按钮本模块不参与肿瘤基因检测流水线的生产。

6.如权利要求1所述的肿瘤基因检测流水线的模块化系统,其特征在于,各个模块按照先后顺序执行或者其中两个以上的模块同时并行。

7.一种肿瘤基因检测流水线的模块化方法,其特征在于,该方法包括:从能够扩充的由白细胞和血浆分离模块、病理检查模块、DNA抽提模块、DNA片段化模块、文库构建模块、捕获DNA模块、以及上机测序模块构成的模块集中配置使用哪些模块及模块之间的连接关系并且配置模块内条件和状态,其中,检测接收到的样本类型,根据检测出的样本类型来配置肿瘤基因检测流水线的模块化系统的模块。

8.如权利要求7所述的肿瘤基因检测流水线的模块化方法,其特征在于,该方法中,检测执行的任务类型,根据检测出的任务类型来配置肿瘤基因检测流水线的模块化系统的模块。

9.如权利要求7所述的肿瘤基因检测流水线的模块化方法,其特征在于,每个模块处于如下七种流程状态中任一种状态:待生产、生产中、待审核、待移交、待审核、异常处理、取消生产以及省略状态。

10.如权利要求9所述的肿瘤基因检测流水线的模块化方法,其特征在于,不参与肿瘤基因检测流水线的模块被设置为省略状态。

11.如权利要求9所述的肿瘤基因检测流水线的模块化方法,其特征在于,在待生产状态,样本从上游生产节点进入本生产节点的;在生产中状态,确定样本开始生产;在待审核状态,样本生产结束等待质量控制审核;在待移交状态,样本审核合格进入下游生产节点;在异常处理状态,样本审核不合格待异常处理;在取消生产状态,生产质量控制不合格但无剩余样本进行再生产。

12.如权利要求7所述的肿瘤基因检测流水线的模块化方法,其特征在于,各个模块按照先后顺序执行或者其中两个以上的模块同时并行。

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