[发明专利]一种基于宿主-肠道微生物互作基因的猪粪便污染特异性分子标记1-38及其检测方法有效

专利信息
申请号: 201610845794.0 申请日: 2016-09-23
公开(公告)号: CN106399303B 公开(公告)日: 2019-02-05
发明(设计)人: 帅江冰;傅玲琳;张晓峰;莫虹斐;曾若雪;何永强 申请(专利权)人: 浙江省检验检疫科学技术研究院;浙江工商大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/689;C12Q1/04
代理公司: 杭州丰禾专利事务所有限公司 33214 代理人: 王从友
地址: 310016 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 宿主 肠道微生物 互作基因 猪粪 特异性分子标记 富集 粪便污染源 竞争性杂交 特异性基因 污染物检测 分子标记 功能分类 宏基因组 基因片段 基因文库 特异性强 灵敏度 检测 靶点 靶向 构建 菌群 文库 污染 筛选 监测
【权利要求书】:

1.一种检测猪粪便污染特异性分子标记1-38的引物和探针组合物,其特征在于,扩增该分子标记的上下游引物和探针构成如下:

上游引物:GGAGGTGGTTAAGCCGATATGTT

下游引物:GCCCCTTTCTTGATACTTTGGA

探针:Fam-AAACTGATTGGAGAAGAATACAGGCG-Tam。

2.一种基于宿主-肠道微生物互作基因的猪粪便污染的检测方法,其特征在于:该方法采用权利要求1所述的引物和探针组合物与被检测样品混合,进行荧光PCR反应,在每个循环延伸结束后读数;样品无Ct值并且无扩增曲线,表示样品中无猪粪便污染;样品扩增Ct值≤35, 且出现典型的扩增曲线,表示样品中存在猪粪便污染;样品Ct值>35的样本建议重做,重做结果无Ct值者为阴性,否则为阳性。

3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于:引物和探针浓度分别为0.2 μM和0.3μM。

4.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于荧光PCR反应条件为:95℃预变性30s,40个循环的95℃变性5s和60℃退火延伸30s。

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