[发明专利]与白叶枯病抗性基因Xa7紧密连锁的SNP分子标记有效
| 申请号： | 201610990500.3 | 申请日： | 2016-11-10 |
| 公开（公告）号： | CN106636349B | 公开（公告）日： | 2020-08-25 |
| 发明（设计）人： | 郑秀婷;彭佩;江南;李为国;熊艳文;李继明 | 申请（专利权）人： | 华智水稻生物技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君 |
| 地址： | 410013 湖南省长沙*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 白叶枯病 抗性 基因 xa7 紧密 连锁 snp 分子 标记 | ||
1.SNP分子标记的检测试剂在检测水稻白叶枯病抗性基因Xa7中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的序列如SEQ ID No.1所示，第61bp位点处的碱基为C或G。
2.引物组合或含有所述引物组合的试剂或试剂盒在检测与水稻白叶枯病抗性基因Xa7紧密连锁的SNP分子标记中的应用；
所述引物组合包括：
(1)两条特异性引物：
Primer X：5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAC-3’；
Primer Y：5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAG-3’；
其中，两条特异性引物分别连接不同的荧光序列；
(2)一条通用引物：
Primer C：5’-GCTGACATGCATCTTCACAT-3’。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，包括如下步骤：
S1、提取水稻样品基因组DNA；
S2、以水稻基因组DNA为模板，利用所述引物组合进行KASP反应检测；
S3、若只检测到引物Primer Y所连荧光序列对应的荧光信号，则判断水稻样品为携带白叶枯病抗性基因Xa7的纯和型；若只检测到引物Primer X所连荧光序列对应的荧光信号，则判断水稻样品为不携带白叶枯病抗性基因Xa7的纯和型；若同时检测到两种荧光，则判断水稻样品为携带白叶枯病抗性基因Xa7的杂合型。
4.与水稻白叶枯病抗性基因Xa7紧密连锁的SNP分子标记的检测试剂在水稻抗病性辅助育种中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的序列如SEQ ID No.1所示，第61bp位点处的碱基为C或G。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，包括如下步骤：
S1、提取水稻样品基因组DNA；
S2、以水稻基因组DNA为模板，利用引物组合进行KASP反应检测；其中，所述引物组合包括：
(1)两条特异性引物：
Primer X：5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAC-3’；
Primer Y：5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAG-3’；
两条特异性引物分别连接不同的荧光序列；
(2)一条通用引物：
Primer C：5’-GCTGACATGCATCTTCACAT-3’；
S3、选择检测到引物Primer Y所连荧光序列对应的荧光信号的水稻样品进行育种。
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