[发明专利]美洲大蠊wingless基因全长鉴定及应用有效
申请号: | 201611019059.0 | 申请日: | 2016-11-17 |
公开(公告)号: | CN106854650B | 公开(公告)日: | 2018-06-12 |
发明(设计)人: | 陈婉;胡超超 | 申请(专利权)人: | 江苏开放大学 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C07K14/435;C12N15/10;C12Q1/6888;C12N15/11;A01N37/46;A01P7/04 |
代理公司: | 南京钟山专利代理有限公司 32252 | 代理人: | 戴朝荣;宁菁 |
地址: | 210036 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 美洲大蠊 蛋白 应用 位点 基因 克隆 蛋白质氨基酸序列 基因全长cDNA 基因序列编码 氨基酸序列 核苷酸序列 开放阅读框 亲水性蛋白 糖基化位点 编码蛋白 基因全长 酶切位点 生物探针 天冬酰胺 等电点 杀虫剂 信号肽 蟑螂 氨基酸 碱基 制备 登录 研究 | ||
1.一种美洲大蠊wingless基因全长cDNA,其特征在于,该基因序列GenBank数据库登录号为KJ680328;所述的cDNA全长序列共1,456bp,其开放阅读框包含1,194个核苷酸,编码397个氨基酸,其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.1所示。
2.一种如权利要求1所述的基因序列编码的蛋白质,其特征在于,其氨基酸序列如序列表中SEQ ID NO.2所示。
3.一种如权利要求1所述的美洲大蠊wingless基因全长cDNA的克隆方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)对从美洲大蠊样本中提取的总RNA进行反转录制备cDNA;
2)以步骤1)中获得的cDNA为模板,简并如SEQ ID NO.3所示的引物F1和如SEQ ID NO.4所示的R1为上游引物和下游引物,进行PCR扩增;
3)在对步骤2)中扩增所得的PCR产物进行回收、连接、转化,以及鉴定和测序;
4)将步骤1)中所获得的RNA作为模板,构建RACE cDNA文库;获得的产物为5'-RACE-Ready cDNA和3'-RACE-Ready cDNA,可分别作为5'-RACE和3'-RACE反应的模板;
5)根据步骤3)中所获得的基因序列设计3'RACE和5'RACE引物,分别以步骤4)中所获得的5'-RACE-Ready cDNA和3'-RACE-Ready cDNA为模板,并使用UPM引物,其核苷酸序列为:5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3’,进行5'-RACE或3'-RACE巢式PCR扩增美洲大蠊wingless基因的全长序列;
所述的3'-RACE和5'-RACE引物的核苷酸序列分别为:
3’RACE-F1:如SEQ ID NO.5所示;
3’RACE-F2:如SEQ ID NO.6所示;
5’RACE-R1:如SEQ ID NO.7所示;
5’RACE-R2:如SEQ ID NO.8所示;
6)回收、连接和转化步骤5)中扩增所得的第一次巢式PCR的5’RACE和3’RACE的PCR产物;
7)将步骤3)中获得的wingless基因序列与步骤6)中获得的5’RACE基因序列进行拼接,根据拼接好的基因序列设计第二次巢式PCR的5'RACE引物,并以步骤4)中所获得的5'-RACE-Ready cDNA为模板,第二次巢式PCR扩增美洲大蠊wingless基因的全长序列;所述的第二次巢式PCR的5'-RACE引物的核苷酸序列分别为:
5’RACE-R3:如SEQ ID NO.9所示;
5’RACE-R4:如SEQ ID NO.10所示。
8)在对步骤7)中扩增所得的第二次巢式PCR的5’RACE的PCR产物进行回收、连接、转化,以及鉴定和测序;
9)将步骤3)中获得的wingless基因序列,步骤6)中获得的5’RACE和3’RACE基因序列与步骤8)中获得的5’RACE基因序列进行拼接,得到wingless基因全长序列,经BLAST比对验证其为美洲大蠊wingless基因全长cDNA序列。
4.如权利要求3所述的一种如权利要求1所述的美洲大蠊wingless基因全长cDNA的克隆方法,其特征在于,步骤2)中,其PCR反应条件如下:94℃3min;94℃30sec,60℃30sec,72℃1min,35cycles;72℃10min;4℃保存。
5.如权利要求4所述的一种如权利要求1所述的美洲大蠊wingless基因全长cDNA的克隆方法,其特征在于,步骤5)中,第一轮PCR反应条件为:94℃30s,72℃3min,5个循环;94℃30s,68℃30s,72℃3min,5个循环;94℃30s,65℃30s,72℃3min,15个循环;72℃10min;4℃保存;优选地,第二轮PCR反应条件为:94℃3min;94℃30s,65℃30s,72℃2min,20个循环;72℃10min;4℃保存。
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