[发明专利]一种DNA序列编辑的方法有效
申请号: | 201611022023.8 | 申请日: | 2016-11-21 |
公开(公告)号: | CN108085328B | 公开(公告)日: | 2021-06-22 |
发明(设计)人: | 王金;赵国屏;张宏 | 申请(专利权)人: | 中国科学院分子植物科学卓越创新中心 |
主分类号: | C12N15/66 | 分类号: | C12N15/66;C12N15/65 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 陈详;陆凤 |
地址: | 200032 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 dna 序列 编辑 方法 | ||
1.一种DNA序列编辑方法,其特征在于,所述方法包括步骤:
提供第一DNA重组片段,所述第一DNA重组片段具有第一筛选标记,和供酶切割的切割位点,通过同源重组将所述第一DNA重组片段整合入所述DNA序列待编辑位点的一侧;
提供第二DNA重组片段,所述第二DNA重组片段具有与所述第一DNA重组片段中的所述切割位点两侧序列同源的同源臂;
酶切割整合入所述DNA序列的所述第一DNA重组片段,在所述切割位点形成切口,通过同源重组将所述第二DNA重组片段整合入待编辑DNA序列中,从而实现所述DNA序列编辑。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的“将所述第一DNA重组片段整合入所述DNA序列待编辑位点的一侧”和“将所述第二DNA重组片段整合入待编辑DNA序列中”中的“整合”分别包括替换目标DNA序列的一段序列或向目标DNA序列中插入一段外源的DNA序列。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第二DNA重组片段中包括替代序列,通过同源重组将待编辑位点替换为所述替代序列。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法包括步骤:
(1)在待编辑DNA序列内设定第一识别位点
所述第一识别位点位于待编辑位点的一侧;
(2)提供第一DNA重组片段
所述第一DNA重组片段具有第一筛选标记,第二识别位点和位于所述第一筛选标记两侧的同源臂,所述同源臂与所述第一识别位点两侧的序列同源;
(3)第一次同源重组
在所述第一识别位点切开待编辑DNA序列,通过同源重组将所述第一DNA重组片段整合入待编辑位点的一侧;
(4)提供第二DNA重组片段
所述第二DNA重组片段具有与所述第二识别位点两侧序列同源的同源臂;
(5)第二次同源重组
在所述第二识别位点切开DNA序列,通过同源重组将所述第二DNA重组片段整合入待编辑DNA序列中,从而实现所述DNA序列编辑。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述第二DNA重组片段中包括替代序列,在步骤(5)中通过第二次同源重组,将所述待编辑位点替换为所述替代序列。
6.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述第二识别位点位于所述第一筛选标记内。
7.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述步骤(5)中通过第二次同源重组去除第一次同源重组中整合入的外源DNA序列。
8.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述DNA序列编辑方法为对基因组特定位点进行编辑的方法。
9.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述同源臂的长度为40bp-1000bp。
10.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述第一识别位点和所述第二识别位点分别独立地选自:酶切位点、CRISPR系统切割位点、TALEN切割位点、ZFN切割位点、Argonaute切割位点中的任意一种或几种。
11.如权利要求10所述的方法,其特征在于,所述的酶切位点为归位核酸内切酶酶切位点。
12.如权利要求11所述的方法,其特征在于,所述的归位核酸内切酶酶切位点为I-SceI酶切位点或I-CeuI酶切位点。
13.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述第一识别位点和所述第二识别位点分别为不同的CRISPR系统所对应的切割位点。
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