[发明专利]从具吞噬能力的免疫细胞中检测肿瘤来源的核酸在审
| 申请号： | 201611023945.0 | 申请日： | 2016-11-14 |
| 公开（公告）号： | CN108070652A | 公开（公告）日： | 2018-05-25 |
| 发明（设计）人： | 郭驰;杜朝阳;张小俊 | 申请（专利权）人： | 北京金沐医疗科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C40B50/06 |
| 代理公司： | 北京三友知识产权代理有限公司 11127 | 代理人： | 韩蕾;姚亮 |
| 地址： | 100176 北京市经济技术*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 肿瘤来源 核酸 免疫细胞 检测 甲基化检测 特异性变异 核酸文库 基因测序 提取核酸 肿瘤发生 外周血 构建 足量 制备 肿瘤 | ||
1.一种制备用于检测肿瘤来源的核酸的样品的方法，该方法包括：
从具吞噬能力的免疫细胞中提取核酸，以用于构建核酸文库，进而用于进行基因测序和/或甲基化检测。
2.一种制备用于检测肿瘤来源的核酸的核酸文库的方法，该方法包括：
从具吞噬能力的免疫细胞中提取核酸；
构建核酸文库，以用于进行基因测序和/或甲基化检测而检测肿瘤来源的核酸。
3.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述具吞噬能力的免疫细胞包括巨噬细胞或DC细胞。
4.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述具吞噬能力的免疫细胞来自外周血，该方法还包括从外周血中分离具吞噬能力的免疫细胞的过程；
优选地，在所述外周血中加入DNaseII抑制剂后再从中分离出具吞噬能力的免疫细胞；和/或，所述外周血来自预先应用溶酶体酸性抑制剂的待测个体。
5.根据权利要求4所述的方法，其中：
所述DNaseII抑制剂包括但不限于Bafilomycin A1、Monensin中的一种或多种；
所述溶酶体酸性抑制剂包括但不限于氯喹、其衍生物或其类似物；优选地，所述待测个体取血前1天预先口服0.5～1g或静脉1～3mg/kg氯喹。
6.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述核酸为DNA；优选地，所述提取核酸的方法为可提取小分子DNA的方法。
7.根据权利要求1或2所述的方法，其中，是从全血、白细胞、单个核细胞、CD14
优选地，所述CD14
8.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述构建核酸文库为采用液相探针捕获法、AmpliSeq法或转座酶法构建DNA文库。
9.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述进行基因测序和/或甲基化检测是对具吞噬能力的免疫细胞中肿瘤来源ptDNA(phagocytized tumor DNA)相关基因进行测序和/或甲基化检测；优选地，还可进一步对基因测序和/或甲基化检测结果进行分析，所述分析包括与基因突变、甲基化图谱进行比较以确定肿瘤类型；
其中，所述肿瘤来源ptDNA相关基因例如可以为头颈部肿瘤相关基因、喉头癌相关基因、咽头癌相关基因、鼻咽癌相关基因、口腔癌相关基因、皮肤癌相关基因、肾癌相关基因、膀胱癌相关基因、甲状腺癌相关基因、睾丸癌相关基因、胃癌相关基因、肺癌相关基因、乳腺癌相关基因、肝癌相关基因、胆管癌相关基因、胆囊癌、神经系统癌相关基因、宫颈癌相关基因、卵巢癌相关基因、食管癌相关基因、子宫内膜癌相关基因、大肠癌相关基因、胰腺癌相关基因、前列腺癌相关基因中的一种或多种。
10.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述样品或核酸文库是用于早期肿瘤、超早期肿瘤的相关检测。
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