[发明专利]一种用于检测水稻橙叶病植原体的引物、方法及应用有效
申请号: | 201611040208.1 | 申请日: | 2016-11-11 |
公开(公告)号: | CN106755317B | 公开(公告)日: | 2020-06-30 |
发明(设计)人: | 周国辉;朱英芝;李战彪 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 王会龙 |
地址: | 510000 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 水稻 橙叶病植 原体 引物 方法 应用 | ||
1.一种用于检测水稻橙叶病植原体的引物,其特征在于,所述用于检测水稻橙叶病植原体的引物包括上游引物及下游引物,所述上游引物具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,所述下游引物具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列。
2.一种用于检测水稻橙叶病植原体的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
(1)制备如权利要求1所述的用于检测水稻橙叶病植原体的引物;
(2)提取待测样品的总DNA;
(3)配制PCR反应体系,进行PCR反应;
(4)电泳检测待测样品中是否含有水稻橙叶病植原体。
3.如权利要求2所述的用于检测水稻橙叶病植原体的方法,其特征在于,所述步骤(2)中提取待测样品的总DNA的步骤为:
a.称取0.1g待测样本于研钵中,用液氮研磨成粉末状后转移至1.5mL离心管中,加入800μL的CTAB提取液,65℃温育30min,期间混匀5-6次;
b.加入等体积氯仿,充分混匀后,12,000rpm离心15min;
c.取上清,加入等体积的异丙醇,-20℃静置30min;
d.25℃离心15min后,将沉淀用75%乙醇洗2-3遍;
e.沉淀干燥后溶于50μL的灭菌ddH2O中,溶解后将总DNA作为PCR扩增模板。
4.如权利要求2所述的用于检测水稻橙叶病植原体的方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR反应体系为:PCR混合液25μL,其中2×Taq PCR StarMix with loading Dye 12.5μL,如上述所述两条引物(使用浓度为10uM)各1μL,模板DNA 1μL及ddH2O 9.5μL。
5.如权利要求2或4所述的用于检测水稻橙叶病植原体的方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR反应体系中的总DNA模板浓度不低于10-1ng/uL。
6.如权利要求2所述的用于检测水稻橙叶病植原体的方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR反应的扩增程序:94℃预变性2min;随后进行35个循环,每个循环包括94℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸60s;最后72℃延伸10min。
7.如权利要求2所述的用于检测水稻橙叶病植原体的方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR反应的退火温度为53℃-60℃。
8.一种用于检测水稻橙叶病植原体的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒具有如权利要求1所述的引物。
9.一种用于检测水稻橙叶病植原体的基因芯片,其特征在于,所述基因芯片具有如权利要求1所述的引物。
10.一种如权利要求1所述的引物在检测水稻橙叶病植原体中的应用。
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