[发明专利]DNA文库的制备方法以及试剂盒有效
申请号: | 201611154433.8 | 申请日: | 2016-12-14 |
公开(公告)号: | CN106835291B | 公开(公告)日: | 2019-02-01 |
发明(设计)人: | 汉雨生;张之宏;揣少坤 | 申请(专利权)人: | 广州燃石医学检验所有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06 |
代理公司: | 北京市柳沈律师事务所 11105 | 代理人: | 张晓飞;易方方 |
地址: | 510000 广东省广州市广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 文库 制备 方法 以及 试剂盒 | ||
1.DNA文库的制备方法,其包括预文库和终文库的制备过程,其中所述的预文库制备过程包括DNA的制备、末端修复和3’端加A,接头连接,接头连接产物纯化,预文库扩增,扩增的预文库纯化,所述的终文库制备过程包括预文库杂交,捕获洗脱,终文库制备,以及终文库的纯化过程;其中所述预文库杂交过程中使用双向短链阻断剂;所述的双向短链阻断剂结构如下:
2.权利要求1所述的制备方法,其中所述的末端修复和3’端加A在一个反应体系中进行。
3.权利要求2所述的制备方法,其中末端修复和3’端加A的反应体系含有ER&AT缓冲液,ER&AT酶,以及cfDNA。
4.权利要求3所述的制备方法,其中末端修复和3’端加A的反应体系条件为:
20℃ 30分钟(85℃热盖)
65℃ 30分钟(85℃热盖)
4℃ 维持。
5.权利要求2-4任一项权利要求所述的制备方法,其中末端修复和3’端加A的反应体系中ER&AT缓冲液:ER&AT酶:cfDNA的体积比为7:3:50。
6.权利要求1所述的制备方法,其中捕获洗脱步骤中用链霉亲和磁珠进行捕获。
7.权利要求6所述的制备方法,其中链霉亲和磁珠量较常规方法使用量减少一半。
8.权利要求6所述的制备方法,其中接头连接产物纯化过程中连接反应体系和磁珠体积比为1:0.8。
9.权利要求1所述的制备方法,其中扩增的预文库纯化过程中PCR体积和磁珠体积比为1:1.2。
10.权利要求1所述的制备方法,其中的DNA文库为cfDNA文库、白细胞gDNA文库或组织来源的DNA文库。
11.权利要求1所述的制备方法,其中还进一步包括纯化的预文库或终文库的质检、纯化的预文库或终文库的片段大小检测过程。
12.权利要求10或11所述的制备方法,其中在进行白细胞gDNA或组织来源的DNA文库构建时,还涉及打断时间、打断稀释液、以及漂洗缓冲液吹打位置的优化。
13.双向短链阻断剂在制备用于DNA文库捕获试剂盒中的用途,其中所述双向短链阻断剂结构如下所示:
14.权利要求13的用途,其中所述DNA文库为cfDNA文库、白细胞gDNA文库或组织来源的DNA文库。
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