[发明专利]XI型成骨不全致病基因FKBP10的突变位点及其应用有效
申请号: | 201611168776.X | 申请日: | 2016-12-16 |
公开(公告)号: | CN106755395B | 公开(公告)日: | 2020-05-12 |
发明(设计)人: | 鲁艳芹;韩金祥;代运章;张遥;牟艳玲 | 申请(专利权)人: | 山东第一医科大学(山东省医学科学院) |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/10;C12N15/11 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 朱玲艳 |
地址: | 250062 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | xi 型成骨 不全 致病 基因 fkbp10 突变 及其 应用 | ||
1.一种XI型成骨不全的检测试剂盒,其特征在于,包括拷贝数变异检测部分和杂合突变检测部分,拷贝数变异检测部分包括: XI型成骨不全致病基因FKBP10外显子2的扩增引物和检测探针,XI型成骨不全致病基因FKBP10外显子3的扩增引物和检测探针,XI型成骨不全致病基因FKBP10外显子4的扩增引物和检测探针, 以及数字化PCR的常规溶液;杂合突变检测部分包括: XI型成骨不全致病基因FKBP10的突变位点的扩增引物和测序引物,以及PCR溶液、PCR产物纯化试剂和Sanger测序试剂;所述XI型成骨不全致病基因FKBP10外显子2的扩增引物和检测探针,该扩增引物为一对,上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示, 检测探针核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,检测探针5’端连接有FAM荧光标记,3’端连接有BHQ1淬灭基团;
所述XI型成骨不全致病基因FKBP10外显子3的扩增引物和检测探针,该扩增引物为一对,上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,检测探针核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示,检测探针5’端连接有FAM荧光标记,3’端连接有BHQ1淬灭基团;所述XI型成骨不全致病基因FKBP10外显子4的扩增引物和检测探针,该扩增引物为一对,上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示,下游引物核苷酸序列如SEQ IDNO.9所示,检测探针核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示,检测探针5’端连接有FAM荧光标记,3’端连接有BHQ1淬灭基团;
所述XI型成骨不全致病基因FKBP10的突变位点的扩增引物和测序引物,该扩增引物为一对,上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示, 测序引物核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示。
2.如权利要求1所述的检测试剂盒,XI型成骨不全致病基因FKBP10的突变位点位于FKBP10基因外显子5的-3bp处,该处核苷酸由C突变为G,突变后该突变所在的cDNA核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
3.如权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述数字化PCR的常规溶液包括2×ddPCR Supermix,去RNase酶与DNase酶水以及微滴发生油。
4.如权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,PCR溶液包括:2.5mM dNTP,含Mg2+的10×PCR缓冲液,5U/μl TaqDNA聚合酶,去RNase酶与DNase酶水;PCR产物纯化试剂包括:1U/μlSAP酶,10U/μl ExoI酶,去RNase酶与DNase酶水。
5.如权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述Sanger测序试剂包括:BigDye3.1混合液、0.125M EDTA溶液、无水乙醇、体积百分比为75%的乙醇溶液,去RNase酶与DNase酶水、Hi-Di甲酰胺溶液。
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