[发明专利]XI型成骨不全致病基因FKBP10的突变位点及其应用

说明书

本发明涉及XI型成骨不全致病基因FKBP10的突变位点及其应用。本发明采用全基因组重测序技术结合数字化PCR、Sanger测序等综合技术，针对临床疑似成骨不全患者进行了全基因组重测序，结合生物信息学发现FKBP10基因外显子2到外显子4存在拷贝数变异，同时外显子5存在杂合剪切位点突变c.918‑3CG。分别通过数字化PCR以及传统PCR基础上的Sanger测序分析，进一步验证了FKBP10外显子2到4的拷贝数变异与杂合剪切突变。拷贝数变异与杂合突变的发现，为探讨XI型成骨不全的发病机制，丰富与发展其诊断方法，从而为临床诊断与治疗提供依据与参考，为开发早期致病基因筛查与治疗等提供基础依据。

技术领域

本发明涉及XI型成骨不全致病基因FKBP10的突变位点及其应用，具体为XI型成骨不全治病基因FKBP10的突变位点及利用该位点进行致病检测的试剂盒，属于突变基因检测技术领域。

背景技术

成骨不全(osteogenesis imperfecta,OI)是一类因I型胶原蛋白合成代谢障碍而引起的遗传性结缔组织疾病.临床症状主要包括骨质疏松、易骨折，部分患者还会有身材矮小、蓝巩膜、牙本质发育不全、早熟性耳硬化、关节及韧带松弛以及肌肉薄弱等症状。患者的个体发病率约为1/10000。

成骨不全具有表型与遗传异质性，其临床表现从轻微、无症状到严重骨骼畸形甚至围产期死亡等严重程度不等。1979年，Sillence根据病人临床体征和影像学等特性将成骨不全分为Ⅰ-Ⅳ型。I-IV型均是由于I型胶原蛋白结构基因COL1A1或COL1A2发生突变所致。其后，V-VII型成骨不全先后从异质性较高的IV型成骨不全患者中分离开来，VIII-XVII型成骨不全根据致病基因的先后发现顺序而命名。

成骨不全具有遗传异质性，存在常染色体显性遗传与常染色体隐性遗传两种遗传方式，其中常染色体显性遗传是由于I型胶原蛋白结构基因COL1A1或COL1A2突变所致或是IFITM5的定点突变所致。常染色体隐性遗传方式涉及到的患者数量少，但是致病基因种类众多，包括SERPINF1、CRTAP、LEPRE1、PPIB、SERPINH1、FKBP10、SP7、BMP1、TMEM38B、WNT1、CREB3L1、SPARC等。其中FKBP10为XI型成骨不全的致病基因。目前关于FKBP10基因突变的成骨不全患者报道数量非常少，主要以点突变为主，目前尚无关于该基因拷贝数变异的报道。

包括全基因组重测序、全外显子组测序、靶向捕获测序等高通量测序技术的出现，为遗传性致病基因的发现提供了有利工具，目前通过高通量发现的遗传性疾病的新致病基因以及致病基因的新发突变位点数量剧增，高通量测序技术结合传统的Sanger测序以及其它单核苷酸多态性检测技术的联合应用，极大的推动了遗传性疾病的基因检测的发展。

成骨不全致病基因新突变位点的发现，对于开展该类疾病的分子诊断具有重要意义。

发明内容

本发明针对现有技术的不足，提供XI型成骨不全致病基因FKBP10的突变位点及其应用。

发明概述

本发明采用全基因组重测序技术结合数字化PCR、Sanger测序等综合技术，针对临床疑似成骨不全患者进行了全基因组重测序，结合生物信息学发现FKBP10基因外显子2到外显子4存在拷贝数变异，同时外显子5存在杂合剪切位点突变c.918-3CG。分别通过数字化PCR以及传统PCR基础上的Sanger测序分析，进一步验证了FKBP10外显子2到4的拷贝数变异与杂合剪切突变。拷贝数变异与杂合突变的发现，为探讨XI型成骨不全的发病机制，丰富与发展其诊断方法，从而为临床诊断与治疗提供依据与参考，为开发早期致病基因筛查与治疗等提供基础依据。

发明详述

本发明技术方案如下：