[发明专利]与南瓜皮色基因连锁的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.与南瓜皮色基因紧密连锁的SNP分子标记，其为分子标记63809或分子标记30774，其特征在于，所述分子标记定位于中国南瓜8号连锁群上，分别位于皮色基因两侧；

所述分子标记63809的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第195位碱基是SNP位点，其碱基为C或T；

所述分子标记30774的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，所述SEQ ID NO.2所示序列自5’端起第32位碱基是SNP位点，其碱基为A或T。

2.用于扩增权利要求1所述的SNP分子标记的引物对。

3.根据权利要求2所述的引物对，其特征在于，所述引物对为dCAPS引物对。

4.根据权利要求3所述的dCAPS引物对，其特征在于，用于检测分子标记63809的dCAPS引物对的核苷酸序列如下所示：

F1：5’-TTCCAACAATTTCCCTCTACTGCGG-3’(SEQ ID NO.3),

R1：5’-TTGCTATTTTCTTGCATTCGATATCCAT-3’(SEQ ID NO.4)，

其对应的限制性核酸内切酶为NlaIII。

5.根据权利要求3所述的dCAPS引物对，其特征在于，用于检测分子标记30774的dCAPS引物对的核苷酸序列如下所示：

F2：5’-CTTGATGAAATTTCCAGAGCCAAAAAGTCAG-3’(SEQ ID NO.5)，

R2：5’-TGCAAAAGATGGAGCGGCGTGTC-3’(SEQ ID NO.6)，

其对应的限制性核酸内切酶为Hpy188I。

6.权利要求1所述的SNP分子标记、权利要求2-5任一项所述的引物对在南瓜果皮颜色辅助育种中的应用。

7.一种用于南瓜果皮颜色辅助育种的试剂盒，其包括权利要求2-5任一项所述的引物对。

8.一种南瓜果皮颜色辅助育种的方法，包括如下步骤：

(1)提取待测南瓜基因组DNA；

(2)利用权利要求2-5任一项所述的引物对进行PCR扩增；

(3)对PCR产物进行测序，确定SNP位点碱基，从而判断果皮颜色；或者使用对应的限制性核酸内切酶对PCR产物进行酶切，根据酶切结果判断果皮颜色。