[发明专利]结合蛋白质组信息和基因组信息的高通量单细胞分析

权利要求书

1.一种非诊断目的的单细胞多核苷酸测序的方法，所述方法包括：

在包含多个细胞的样品中消除不感兴趣的细胞以获得在第一浓度的多个感兴趣的细胞；

在通道中声聚焦所述多个感兴趣的细胞到核心流中以将所述通道中所述多个感兴趣的细胞的浓度从所述第一浓度增加到更高的第二浓度；

流式细胞术地分离处于更高的第二浓度下的所述多个感兴趣的细胞以产生感兴趣的已分离细胞；

生成一种或多种所述感兴趣的已分离细胞的一种或多种多核苷酸的分子索引的多核苷酸文库；并且

获得所述分子索引的多核苷酸文库的序列信息，从而确定所述一种或多种多核苷酸的序列信息。

2.如权利要求1所述的方法，其中声聚焦所述多个感兴趣的细胞包括基于细胞大小聚焦所述多个感兴趣的细胞。

3.如权利要求1所述的方法，其中声聚焦所述多个感兴趣的细胞包括：

将所述多个感兴趣的细胞悬浮在所述通道中；并且

将所述通道暴露于平行于流动方向的轴向声驻波场，其中所述轴向声驻波场将所述多个感兴趣的细胞沿着所述通道的中心轴驱动到潜在力最小值的位置，以产生均匀间隔的细胞。

4.如权利要求1和2中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括流体动力学聚焦、磁场聚焦、电场聚焦、重力场聚焦、光学场聚焦或其组合。

5.如权利要求1所述的方法，其中流式细胞术地分离所述多个感兴趣的细胞包括利用荧光激活细胞分选流式细胞术地分离所述多个感兴趣的细胞。

6.如权利要求1所述的方法，其中流式细胞术地分离所述多个感兴趣的细胞包括将所述多个感兴趣的细胞沉积到各自包括至少96个微孔的一个或多个微量滴定板中。

7.如权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种多核苷酸包括核糖核酸(RNA)。

8.如权利要求7所述的方法，其中所述核糖核酸是信使RNA(mRNA)。

9.如权利要求1所述的方法，其中所述序列信息包括至少10个基因的转录物计数。

10.如权利要求1所述的方法，其中所述序列信息包括以下一种或多种的转录物计数：CD4、FOX01、CD45RO、MYC、IL1R2、PRF1、GZMK、LGALS1、IL17F、IL23R、LYNX1、PRDM1、SELL、SMAD4、ICOS、IKZF5、RORC、AHRR、CTLA4、ITGB7、ENTPD1、CCR8、TSHR、TGFB2、IL12A、IL7R、HLA-DMA、CCR5、TIAF1、BCL6、BHLHE40、CXCR4以及CD307c基因。

11.如权利要求1所述的方法，其中所述序列信息包括以下一种或多种的转录物计数：CD3D、GSTP1、TCF7、CD3E、RNB6、RB1、MYB、CD3G、KRT8、CDH1、ERBB3、ERBB2、TCTN1、ESR1、CDKN1A以及TFF3基因。