[发明专利]在触发碎裂能量的同时迅速扫描宽四极RF窗

说明书

使用离子源将样本离子化，且使用串级质谱仪接收离子束。将m/z范围划分成两个或多于两个前体离子隔离窗。选择碎裂参数的两个或多于两个值。所述碎裂参数的所述两个或多于两个值中的第一值具有使所述离子束的最小量离子碎裂的水平。一或多个额外值具有使所述离子束的所述离子产生越来越多的碎裂的越来越具侵攻性的水平。针对每一前体离子隔离窗，指令所述串级质谱仪使用所述前体离子隔离窗及所述第一值来执行对所述离子束的选择及碎裂，且指令所述串级质谱仪使用所述前体离子隔离窗且使用所述一或多个额外值来执行对所述离子束的一或多个额外选择及碎裂。

相关申请案的交叉参考

本申请案主张2015年2月5日提出申请的序列号为62/112,603的美国临时专利申请案的权益，所述临时专利申请案的内容以全文引用的方式并入本文中。

背景技术

导论

各种实施例一般来说涉及质谱术，且更明确地说涉及用于在数据独立采集(DIA)串级质谱术方法中提供允许使产物离子与前体离子相关的前体离子信息的系统及方法。

串级质谱术或质谱/质谱术(MS/MS)是用于分析化合物的众所周知的技术。最初，将串级质谱仪视为以串级方式布置的两个质谱仪。然而，现代串级质谱仪是复杂得多的仪器且可具有许多不同配置。然而，一般来说，串级质谱术涉及将来自样本的一或多种化合物离子化、选择所述一或多种化合物的一或多个前体离子、将所述一或多个前体离子碎裂成若干产物离子且对所述产物离子进行质量分析。

串级质谱术可提供定性及定量信息两者。产物离子光谱可用于识别所关注分子。一或多个产物离子的强度可用于对存在于样本中的化合物的量进行定量。

大量不同类型的实验方法或工作流可使用串级质谱仪来执行。这些工作流中的两个宽广类别是信息相依采集(IDA)及数据独立采集(DIA)。

IDA是一种其中在将样本引入到串级质谱仪中时用户可规定用于执行MS/MS的准则的灵活串级质谱术方法。举例来说，在IDA方法中，执行前体离子或质谱术(MS)调查扫描(survey scan)以产生前体离子峰值列表。用户可选择在峰值列表上筛选前体离子的子组的峰值列表的准则。接着，对前体离子的子组中的每一前体离子执行MS/MS。产生每一前体的产物离子光谱。对前体离子的子组中的前体离子重复地执行MS/MS。样本被引入到串级质谱仪中。举例来说，样本是通过注射或色谱仪运行而引入。

一种类型的IDA方法称作多反应监测(MRM)或选定反应监测(SRM)或者称作MRM或SRM扫描或跃迁(transition)。MRM通常用于定量分析。换句话说，MRM通常用于从单个产物离子的强度量化样本中的前体离子的量。MRM用于包含药物测试及杀虫剂筛选方法以及其它方法的多分析物筛选方法。

然而，在蛋白质组及许多其它样本类型中，化合物的复杂性及动态范围是非常大的。这对传统IDA工作流提出挑战，要求非常高速度的MS/MS采集以深度地探测样本以便识别并量化分析物的宽广范围。因此，已使用DIA工作流来增加数据收集的再现性及综合性。

在传统DIA工作流中，基于在前一扫描中采集的数据，串级质谱仪的动作在各扫描间无变化。替代地，选择前体离子质量范围。接着，对所述质量范围中的所有前体离子进行碎裂，且对所有前体离子的所有产物离子进行质量分析。此前体离子质量范围可非常狭窄，其中多个前体在窗内的可能性较小。或者，此窗可较大，且多个前体在此窗内的可能性较高。

DIA的其它名称可包含但不限于MS/MS^ALL或非特定碎裂方法。SWATH^TM采集也是一种类型的DIA工作流。在SWATH^TM采集中，前体离子质量隔离窗跨过整个质量范围。对每一质量隔离窗中的所有前体离子进行碎裂，且对每一质量隔离窗中的所有前体离子的所有产物离子进行质量分析。