[发明专利]用于根据生物学数据的亚群检测的方法、系统和装置

权利要求书

1.一种用于检测至少一个生物学有机体的组成的亚群的系统(100)，所述系统由至少一个硬件处理器来实施，并且所述系统包括：

向量信号形式化模块(112)，其被配置为将根据所述至少一个生物学有机体的所述组成的群组而编译的生物学数据形式化为存储介质(108)的至少一个数据结构内的离散时间实值向量信号的集合，所述生物学数据包括基因组数据，其中，所述形式化包括通过基因组的特性来定义所述向量信号并将所述基因组的区域表示为时间值；

频域分析器(114)，其被配置为对所述生物学数据的所述向量信号执行频域分析以编译所述向量信号的谱性质，并将所述谱性质与所述群组的所述组成相关联；以及

亚群检测模块(118)，其被配置为通过向所述谱性质应用相似性度量来识别所述至少一个生物学有机体的所述亚群，并引导对所述识别的亚群的表示的显示，其中，所述识别包括：构建(604)群体树，所述群体树包括所述组成的亲本-子本对，并且基于所述相似性度量来形成(606)表示每个所述对的亲本与子本之间的相异性的群体相异性指数。

2.一种用于检测至少一个生物学有机体的组成的亚群的方法(200)，所述方法由至少一个硬件处理器来实施，并且所述方法包括：

将根据所述至少一个生物学有机体的所述组成的群组而编译的生物学数据形式化(204)为存储介质的至少一个数据结构内的离散时间实值向量信号的集合，所述生物学数据包括基因组数据，其中，所述形式化包括通过基因组的特性来定义所述向量信号并将所述基因组的区域表示为时间值；

对所述生物学数据的所述向量信号执行(206)频域分析以编译所述向量信号的谱性质；

将所述谱性质与所述群组的所述组成相关联(208)；并且

通过向所述谱性质应用相似性度量来识别(210)所述至少一个生物学有机体的所述组成的所述亚群，其中，所述识别包括：构建(604)群体树，所述群体树包括所述组成的亲本-子本对，并且基于所述相似性度量来形成(606)表示每个所述对的亲本与子本之间的相异性的群体相异性指数。

3.根据权利要求2所述的方法，其中，所述谱性质包括功率谱密度或总谱能量中的至少一个。

4.根据权利要求2所述的方法，其中，所述执行包括将所述基因组数据的至少一部分形式化为不同基因组事件的至少一个线性组合。

5.根据权利要求4所述的方法，其中，所述基因组事件包括以下中的至少一项：拷贝数改变事件、突变、基因表达数据事件、或甲基化数据事件。

6.根据权利要求4所述的方法，其中，所述执行包括确定(508)针对所述不同基因组事件中的每个基因组事件的功率谱密度或总谱能量中的至少一个。

7.根据权利要求2所述的方法，其中，所述识别还包括通过检测所述群体相异性指数的不同峰值的总数来确定(608)所述亚群的总数。

8.根据权利要求7所述的方法，其中，所述生物学数据包括基因组数据，其中，所述形式化包括对所述基因组数据执行(408)主成分分析，以获得表示基因组区域的线性组合的主成分，并且其中，所述向量信号包括所述主成分。

9.根据权利要求8所述的方法，其中，所述识别包括通过采用不同峰值的所述总数作为与所述亚群的所述总数相对应的聚类流程的高度截止来对所述向量信号和所述谱性质的组合执行(612)所述聚类流程。

10.根据权利要求2所述的方法，还包括：

显示(212)所述识别的亚群的表示。

11.一种包括计算机可读程序的计算机可读介质(908)，所述计算机可读程序当在计算机上运行时使得所述计算机能够执行根据权利要求2所述的方法。