[发明专利]用于鉴定病毒性出血败血症病毒的区域特异性基因型的探针及其用途在审
| 申请号： | 201680037245.9 | 申请日： | 2016-08-11 |
| 公开（公告）号： | CN107810275A | 公开（公告）日： | 2018-03-16 |
| 发明（设计）人： | 赵眉英;朴明爱;池宝荣;黄晟敦;金光一;安祥重 | 申请（专利权）人： | 大韩民国（国立水产科学院） |
| 主分类号： | C12Q1/6818 | 分类号： | C12Q1/6818;C12Q1/70;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司： | 北京市中伦律师事务所11410 | 代理人： | 杨黎峰,钟锦舜 |
| 地址： | 韩国*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 鉴定 病毒性 出血 败血症 病毒 区域 特异性 基因型 探针 及其 用途 | ||
1.一种用于鉴定病毒性出血败血症病毒(VHSV)的区域特异性基因型的探针，其中，所述探针能够在严格条件下与VHSV G蛋白序列中具有C755A和A756G单核苷酸多态性突变的序列片段杂交。
2.根据权利要求1所述的探针，其中，所述探针由5至20个核苷酸组成。
3.根据权利要求1所述的探针，其中，所述探针在第8和第9位置处具有对应于能确定VHSV的区域特异性基因型的G蛋白单核苷酸多态性(SNP)位点的序列。
4.根据权利要求1所述的探针，其中，所述探针由序列号1表示。
5.一种用于确定病毒性出血败血症病毒(VHSV)的区域特异性基因型的PNA探针，其中，该PNA探针包含连接到权利要求1-4中任一项所述的探针两端的报告基因或猝灭剂。
6.根据权利要求5所述的PNA探针，其中，所述报告基因是选自由FAM(6-羧基荧光素)、德克萨斯红、HEX(2',4',5',7',-四氯-6-羧基-4,7-二氯荧光素)、JOE、Cy3和Cy5组成的组中的一种或多种。
7.根据权利要求5所述的PNA探针，其中，所述猝灭剂是选自由TAMRA(6-羧基四甲基若丹明)、BHQ1、BHQ2和4-(4-二甲氨基苯基偶氮)苯甲酸(Dabcyl)组成的组中的一种或多种。
8.一种用于检测能确定VHSV的区域特异性基因型的单核苷酸多态性(SNPs)的试剂盒，其中，该试剂盒包含权利要求1-4中任一项所述的探针。
9.一种用于检测能确定VHSV的区域特异性基因型的单核苷酸多态性(SNPs)的试剂盒，其中，该试剂盒包含权利要求5所述的PNA探针。
10.一种检测能确定VHSV的区域特异性基因型的单核苷酸多态性(SNPs)的方法，该方法包含以下步骤：
(a)从VHSV中分离靶DNA；
(b)使所述靶DNA与权利要求1-4中任一项所述的探针杂交；
(c)获得温度依赖性熔解曲线，同时增加步骤(b)产生的杂交产物的温度；
以及(d)分析所获得的熔解曲线。
11.一种通过使用PNA来检测能确定VHSV的区域特异性基因型的单核苷酸多态性(SNPs)的方法，该方法包含以下步骤：
(a)从VHSV中分离靶DNA；
(b)使所述靶DNA与权利要求5所述的PNA探针杂交；
(c)获得温度依赖性熔解曲线，同时增加步骤(b)产生的杂交产物的温度；
以及(d)分析所获得的熔解曲线。
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