[发明专利]用于确定生物分子的尺寸的方法有效
申请号: | 201680038600.4 | 申请日: | 2016-06-30 |
公开(公告)号: | CN107787452B | 公开(公告)日: | 2021-05-18 |
发明(设计)人: | L.比约克斯滕;N.施塔夫斯特龙 | 申请(专利权)人: | 思拓凡瑞典有限公司 |
主分类号: | G01N27/447 | 分类号: | G01N27/447 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 吴俊;张金金 |
地址: | 瑞典乌*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 确定 生物 分子 尺寸 方法 | ||
1.一种用于使用已知尺寸的标记分子由电场确定介质中分离的生物分子的尺寸的方法,其特征在于,
- 检测多个带,并且基于分离标准形成检测的标记序列和检测的未知序列,
- 确定每个检测的带的带性质,
- 将所述检测的标记序列的所述检测的带的所述带性质与形成已知标记序列的多个标记分子的已知带性质相比较,并且将得分指定给每个比较,所述得分基于带之间的相对距离、相对强度、预期距离和预期强度中的至少一种,
- 选择具有最高得分的比较,并且根据所述比较使所述检测的标记序列的所述检测的带的全部或子集与所述已知标记序列的所述多个标记分子相关联,以确定所述检测的标记序列的全部或子集的尺寸,以及
- 将所述检测的标记序列的所述带与所述检测的未知序列的所述带相比较,以基于所述标记分子的已知尺寸来确定所述检测的未知序列的每个识别的带的生物分子的尺寸。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,通过将所述检测的标记序列的带性质与所述已知标记序列的已知带性质相比较,并且允许所述检测的标记序列中的附加带或遗漏带,但不允许改变所述检测的标记序列中的所述带的顺序来进行所述比较。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其特征在于,所述检测的带的所述带性质包括位置和强度中的至少一种。
4.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其特征在于,所述分离标准是所述检测的带在不同泳道中检测。
5.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其特征在于,所述分离标准是所述检测的带具有不同颜色。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述分离标准是所述检测的带具有一种颜色的第一强度和另一种颜色的第二强度,以及能够确定所述第一强度和所述第二强度的强度比。
7.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其特征在于,所述检测的标记序列的所述检测的带用于创建校准曲线,并且所述检测的未知序列的生物分子的尺寸通过将所述检测的未知序列的检测的带的带性质与所述校准曲线相比较来确定。
8.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其特征在于,所述生物分子是蛋白质。
9.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其特征在于,所述得分通过将所述检测的标记序列的带和所述已知标记序列的带的相对距离、相对强度、预期距离和/或预期强度相比较来确定。
10.一种在其上存储有指令的计算机可读介质,所述指令当被执行时促使计算系统执行根据权利要求1-9中的任一项所述的方法。
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