[发明专利]用于检测病毒的改善的组合物和方法

权利要求书

1.检测病毒的方法，包括；

鉴定在合适的宿主细胞被所述病毒感染时以3％和10％之间表达的高度保守的核苷酸测试序列；

合成与所述测试序列至少部分互补的探针序列；

使所述探针序列与所述测试序列杂交以形成杂交复合体；和

检测所述杂交复合体。

2.权利要求1所述的方法，其中所述核苷酸测试序列的长度在30和200个核苷酸之间。

3.权利要求1所述的方法，其中所述核苷酸测试序列在60和90个核苷酸之间。

4.权利要求1所述的方法，其中所述测试序列代表非翻译区。

5.权利要求1所述的方法，其中所述测试序列在合适的宿主细胞被所述病毒感染时以大于5％被表达。

6.权利要求1所述的方法，其中所述核苷酸测试序列包括位于转录调控序列上游的5’非翻译区的前导序列。

7.权利要求1所述的方法，其中所述探针序列在表1中被鉴定。

8.权利要求1所述的方法，其中所述探针序列包括与所述测试序列互补性的0.5％和10％之间的缺少。

9.权利要求1所述的方法，其中所述探针序列包括非自然存在的核苷酸。

10.权利要求9所述的方法，其中所述非自然存在的核苷酸包括LNA。

11.权利要求1所述的方法，其中所述探针序列包含可检测标签。

12.权利要求11中所述的方法，其中所述可检测标签选自荧光团、发色团、旋转标签、放射性同位素、亲和表位、和质量标签。

13.权利要求1所述的方法，其中所述病毒是RNA病毒。

14.权利要求1所述的方法，其中所述病毒选自冠状病毒、星状病毒科、杯状病毒科、小核糖核酸病毒科、黄病毒科、反转录病毒科、披膜病毒科、沙粒病毒科、布尼亚病毒科、丝状病毒科、正黏病毒科、副黏病毒科、弹状病毒科、和呼肠病毒科。

15.权利要求1所述的方法，其中所述病毒是SARS或MERS的致病因素。

16.权利要求1所述的方法，其中所述病毒是流感病毒。

17.权利要求1所述的方法，其中所述杂交复合体包含多核苷酸双链体。

18.权利要求1所述的方法，其中所述杂交复合体包含多核苷酸三链体。

19.权利要求1所述的方法，其中实施该检测步骤而无外源聚合酶驱动的扩增步骤。

20.权利要求1所述的方法，其中所述检测步骤还包括扩增步骤，其中使用外源聚合酶复制至少部分所述测试序列。

21.权利要求20所述的方法，其中所述扩增步骤包括PCR。

22.权利要求21所述的方法，其中所述扩增步骤包括RT-PCR。

23.权利要求21所述的方法，其中所述扩增步骤包括实时RT-PCR。

24.权利要求21所述的方法，其中所述扩增步骤包括巢式PCR。